Clustal x

Deze applicatie heeft een algemene uitlijningsprogramma voor meerdere sequentie voor DNA of eiwitten.
Download nu

Clustal x Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • The European Bioinformatics Institute
  • Besturingssystemen:
  • Windows All
  • Bestandsgrootte:
  • 4.7 MB

Clustal x Tags


Clustal x Beschrijving

CLUSTAL X is een geavanceerd programma dat zich bezighoudt met meerdere sequentie-uitlijning voor eiwitten en DNA. Ontworpen als een GUI voor Clustalw voert het programma in diepte-reeksanalyse uit, terwijl u ook vele nutsvoorzieningen aanbiedt om de juiste vergelijkingen uit te voeren. Laad meerdere gespecialiseerde indelingenHet programma kan werken met ready-sequenties, geïmporteerd uit bestanden van de volgende indelingen: EMBL / SwissProt, NBRF / PIR, PEARSON (FASTA), GCG / MSF (PILLUP), CLUSTAL (* .AlN), GCG9 / RSF en GDE. Tijdens het importproces probeert clustal x te detecteren of de sequenties nucleotiden of aminozuren zijn, maar er is geen echte garantie dat de keuze correct is. Slim benadrukken van belangrijke elementen die het bronbestand is geladen, wordt de uitlijning van de sequentie weergegeven in het hoofdvenster van het programma. Het ingebouwde kleurende schema dient om geconserveerde functies te markeren, waardoor ze worden uitgeschakeld via levendige kleuren. Om de inhoud van de sequenties te onderscheiden, wordt aanbevolen dat u een groter lettertype gebruikt; Dit resulteert in een ingezoomde reeksweergave, waardoor het gemakkelijker is om zijn samenstelling te herkennen. Eenvoudig uitlijningsprocesDe bewerkingen die door het programma zijn toegestaan, maken behoorlijk de lijst; U kunt een reeks toevoegen aan een bestaande uitlijning, een fragment of een fragment versnellen of plakken, en om naar een string te zoeken of om bestaande gaten te verwijderen. Ook kunt u uitlijningen uitvoeren via een van de volgende methoden: voltooid (de reeks zal een volledige analyse ondergaan), alleen geleideboom of een herschikking van de geselecteerde sequenties en / of residubereiken. Het wordt aanbevolen om alvorens een uitlijningsproces te starten, alle parameters (nieuwe gaten, eiwit-gaten) instellen om de resultaten te sluiten. Gegevens analyseren en een uitlijningskwaliteit krijgen van het belangrijkste indicatief voor de analyse is de uitlijnkwaliteitsscore, die voor elke kolom afzonderlijk wordt geplot. Een hoge score duidt een goed geconserveerde kolom aan, terwijl een lage instandhoudingsniveaus worden aangegeven door een lagere score. In conclusie is de analyse afhankelijk van een verscheidenheid aan parameters, die moeten worden ingesteld in overeenstemming met het wetenschappelijk doel dat moet worden uitgevoerd. Absoluut, het programma maakt een uitstekende keuze voor wetenschappers, evenals studenten die op zoek zijn om een drager uit DNA-sequencing te maken. Beoordeeld door Andrea Matei, laatst bijgewerkt op 21 juli 2014


Clustal x Gerelateerde software