Copasi Biochemische netwerkenanalyse en simulatie gemakkelijk gemaakt.
Download nu

Copasi Rangschikking & Samenvatting

Copasi Tags

analyse Analyseren Signaling Networks Analyse Biochemical System Pathway biochemisch biochemische kinetiek biochemische simulator Neem contact op met Netwerken Analyse biochemische vergelijking Simuleer biochemische netwerken Biochemical Networks Analyse biochemische netwerken

Copasi Beschrijving

Copasi is een betrouwbare tool die is ontworpen om u te helpen biochemische netwerken en hun dynamiek te analyseren. Het bevat een eenvoudig te gebruiken GUI waarmee u de netwerken kunt configureren, taken toevoegen en rapporten kunt genereren. Deze tool wordt geleverd als een stand-alone programma dat modellen in de SBML-standaard ondersteunt en hun gedrag kan simuleren met behulp van ODES of Gillespie's Stochastic Simulation Algoritme; Willige discrete evenementen kunnen in dergelijke simulaties worden opgenomen. Copasi voert verschillende analyses uit van het netwerk en de dynamiek en heeft uitgebreide ondersteuning voor parameterschatting en -optimalisatie. Copasi biedt middelen om gegevens in aanpasbare percelen, histogrammen en animaties van netwerkdiagrammen te visualiseren Belangrijkste kenmerken: Model: chemisch reactienetwerk. willekeurige kinetische functies. Odes voor compartimenten, soorten en wereldwijde hoeveelheden. -opdrachten voor compartimenten, soorten en wereldwijde hoeveelheden. Eerste opdrachten voor compartimenten, soorten en wereldwijde hoeveelheden. SBML-import (L1v1 + 2, L2v1-4) en export (L1v2, L2v1-4). -analyse: Stochastische en deterministische tijdcursussimulatie steady state analyse (inclusief stabiliteit). Metabolic Control Analyse / gevoeligheidsanalyse. Elementaire modusanalyse. massabehoudsanalyse. tijdschaalscheidinganalyse Berekening van Lyapunov-exponenten. parameter scans. optimalisatie van willekeurige objectieve functies. Parameterschatting met behulp van gegevens van tijdcursus en / of stabiele staatsexperimenten gelijktijdig. Grafische gebruikersinterface (COPASIUI) Sliders voor interactieve parameterwijzigingen. Kleurgecodeerde tafels 3D-staafdiagrammen percelen en histogrammen. Netwerkdiagramvisualisatie van resultaten. -opdrachtregel (COPASISE) voor batchverwerking. -versies voor MS Windows, Linux, Mac OS X en Solaris SPARC. Loading van Legacy Gepasi-bestanden. Exporteren naar Berkeley Madonna, XPPAUT en C Broncode van het Ode-systeem gegenereerd uit het model. Besparing van wiskundige formules en odes in MathML of latex

Copasi Gerelateerde software