DNA-draak

DNA Sequence Contig Assembler Software
Download nu

DNA-draak Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Trial
  • Naam uitgever:
  • SequentiX
  • Bestandsgrootte:
  • 486 KB

DNA-draak Tags


DNA-draak Beschrijving

DNA Dragon is een geavanceerde DNA hulpprogramma dat kan meer dan 100.000 monsters van reeks formaten (FASTA, EMBL, GenBank, etc.), trace bestandsformaten (SCF, ABI, AB1) en next generation sequencing bestandsformaten (Illumina, SFF, GFF , enzovoort). Opmerking : De proef kan worden geactiveerd met behulp van de "licentie knop" in de software. Belangrijkste kenmerken: leest de meest gebruikte formats. (FASTA, GenBank, EMBL, SCF, ABI, AB1, SSF, Next Generation) Meerdere trimmen functies:. Vector, kwaliteit en lengte trimmen Snelle montagemachine handgrepen projecten met meer dan 100.000 sequenties. Ondersteunde bestandsindelingen: Project bestanden: XML DNA Dragon XML project (* .XML) Sequence bestandsformaten: EMBL (* .eb;. * Ebi;. * EMBL) GenBank (* .NL, * gen;. * GenBank;.. * .Txt) FASTA (* .fa, fas *;. * Snel;. * FASTA;. * Fs;. * FSA;.. * FSTA) Next generation sequencing bestandsformaten: ABI SOLiD-bestanden (* .gff) SOLiD CSFASTA-bestanden (* .csfasta) Solexa Compact ASCII lezen Format, sjaal (s _ * _ sequence.txt) Illumina _seq.txt-bestanden (* .txt) Illumina FASTQ-bestanden (* .fastq) Illumina Qseq-bestanden (* _qseq.txt) 454 standaard flowgram-bestanden (* .sff) Alignment bestandsformaten: Sequence Alignment / kaart (SAM) Format (* .SAM) Binary Alignment Format (* .bam) (* .bam) Trace bestandsformaten: SCF (* .scf) ABI (* .abi;. * AB1) Navigator boom: Een monster navigator boom maakt de projectstructuur (contigs en monsters) duidelijk. Hier worden de monsters geselecteerd en bijgesneden en geassembleerd. Trimmen en untrimming kenmerken: Primer-Clipping Vector-Knippen met automatische pseudocircularization (50 basen). U kunt vermeende vector motieven in de sequenties te detecteren zonder enige voorkennis. Sequence op basis van kwaliteit trimmen lengte trimmen Untimming. Restores geknipte uiteinden Vergadering machine en contig editor: Verschillende opties om te veranderen de assemblage parameters zijn beschikbaar. De snelle, geïndexeerde verzameling van sequenties met automatische sortering van de sequenties binnen de contigs (offset en afwerking uiteinden) maakt het projectbeheer plezierig. De revisie van de contigs (sequentiepositionering), d.w.z. vergelijking van basen met hun sporen en de uitvoer / kopiëren van de consensussequenties bijna vanzelfsprekend.


DNA-draak Gerelateerde software

AVL

Een Vortex-Lattice-model het beste geschikt voor aerodynamische configuraties die voornamelijk uit dunne tillen bestaan ... ...

528 311 KB

Downloaden