Dnadististorie

Een software voor op afstand gebaseerde fylogeny-inferentie van DNA-sequenties.
Download nu

Dnadististorie Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • Christian Michel
  • Besturingssystemen:
  • Windows All
  • Bestandsgrootte:
  • 393 KB

Dnadististorie Tags


Dnadististorie Beschrijving

Dnadistree is ontworpen om op afstand gebaseerde fylogenetische bomen die nauwkeurige topologische relaties tussen soort weergeven. Meer juist, Dnadistree voert verschillende opeenvolgende stappen uit: 1. Het leest DNA-sequentie-uitlijningen (nucleotiden of codons); 2. Het schat onpartijdige paarse afstanden tussen elk paar sequenties. Voor dat doel gebruikt Dnadistree talloze formules vaak gebaseerd op evolutionaire modellen van zowel DNA- of CODON-modellen (zie hier voor meer informatie); 3. Het bouwt fylogenetische boom dankzij vier agglomeratieve algoritmen; 4. Het berekent statistische maatregelen met betrekking tot afstandsmatrices en / of op afstand gebaseerde bomen. Desalniettemin is dnadistree niet ontworpen om de robuuste lengtes van de tak te schatten; Het wordt aanbevolen om Fitch (in het Phylip-pakket), Fastme, Phyml of Paml te gebruiken met de bomen afgeleid door Dnadistree als gebruikersstructuur voor meer nauwkeurige schattingen op afstand- of ML-filiaal. Geef DNADISTREE een PROBEER TE ZIEN WAT HET ECHT IS GEBEURTEN!


Dnadististorie Gerelateerde software