Dotplot DOT PLOT-analyse-tool
Download nu

Dotplot Rangschikking & Samenvatting

Dotplot Tags

analys analyse DOT-bestand maken patroon plotcursus Verhaallijn plot maken Maak een punt punt dot ilustrator Dot-resisator punt product plotgereedschap dot lettertype Geanimeerde punt patroon Desktop Dot plot loopstats opslaan plotdiagram Aanpasbare plot logisch plot tonen dot bestand Converteer perceel plot analyse Perceel analyzer volgorde Traject Perceelanalyse plot LMA tweedimensionale plot driedimensionale plot hydropathie plot interactieve Ramachandran plot DOT Inspectie multiple plot plot logging

Dotplot Beschrijving

Probeer voor snelle tevredenheid twee neuronale nicotine-acetylcholine-receptor-subeenheidsequenties uit SwissProt opgeslagen onder de bestandsnamen A2 en A3. De interface is net als elk ander Windows-programma. Gebruik het pop-upmenu Bestand om de horizontale sequentie te laden. U krijgt een dialoogvenster die alle bestanden in de huidige map vermeldt. Selecteer A2 en vervolgens geeft het programma een SEQINFO-dialoogvenster, dat u een beetje over de reeks vertelt die u net hebt geladen, dwz. zijn naam, lengte, sequence-indeling en of het DNA, RNA of Eiwit is. Klik OK. Herhaal dan voor de verticale sequentie, het kiezen van A3. Net als in de MSDOS-versie zijn er twee manieren om de dotplot te berekenen, hieronder in detail beschreven. Gebruik voor een snelle oplossing de optie Identiteiten in het pop-upmenu Teken. De standaardparameters zijn een raamgrootte van 10 en een drempel van 6. Dit geeft een diagonale lijn over uw scherm. Probeer de dotplot te tweaken door op Parameters te klikken en de drempel in te stellen op 1. Mooi, toch? U kunt zelfs de drie transmembraangebieden zien in het midden van het eiwit en de laatste transmembraan op de C-Terminus. Probeer de interne herhalingen in een menselijke epidermale groeifactorreceptor te vinden. Om dit te doen, laadt u de reeks genaamd EGFR als zowel de horizontale als de verticale sequentie. Stel vervolgens de parameters in als venster = 20 en drempel = 1. Laad de Matrix PAM250.MAT-score met behulp van het optie Bestand pop-upmenu "Open Matrix". De Dotplot-toepassing is ontwikkeld om DOT PLOT-analyse-tool te zijn.

Dotplot Gerelateerde software