Erminej Analyseer gen-sets met deze applicatie.
Download nu

Erminej Rangschikking & Samenvatting

Erminej Tags

analys analyse uitdrukking genexpressie gen Applicatie analyseren sets Gene-set analyseren Vind Gene Set haal genen subset uit Gene subsetzoeker Grab genen subset Bekijk gengegevens Geef-gengegevens weergeven Gene-expressie analyseren gencorrelatie correlaat gen Analyseer Gene genorganisatie genvisualisatie Vergelijk Gene gen vergelijker gen kandidaat-gen genmutatie simuleren gen-adjaciteit gen annotatie Gene Ontology databank Genontologie Maak gen-netwerk gen-netwerkgenerator GEN INFORMATIE genproductassociatie associatie met genziekten Gene-ID-vertaler gen-functie voorspelling genidentificatie Analyse genstructuur Genstructuuranalysator Gene Mapper gen-ordervergelijking vergelijk de genvolgorde gen-inhoud afgeleid Analyse eiwit-coderinggen genectie Analyseer genetische gegevenssets Analyse 16S RRNA-gensequentie Ancestral Gene Cluster rekenmachine voor genenclusters Ancestral Gene gen analyseer gengegevens Gegevensanalyse expressie micro-array-gegevens Analyseer genmarkeringen overdracht van genen Simuleer het GEN-netwerk duplicatie van genen analyseren gen frequentiegegevens schat geniversiteiten Test gen Diversiteiten Gendiversiteit Genequentie Gen-gen-interactie Gensequentienaam genclusters betrouwbaarheid Analyseer Modifier Gene ziektegen in kaart brengen Visualiseer gen Ontdek Gene bekijk gen

Erminej Beschrijving

Erminej is handig, eenvoudig te gebruiken tool die is ontworpen om u te helpen analyse van gen-sets uit te voeren in expressie micro-array-gegevens of andere genoombrede gegevens die resulteren in ranglijsten van genen. Een typisch doel is om te bepalen of bepaalde biologische routes "iets interessants" in de gegevens doen. De software is ontworpen om te worden gebruikt door biologen met weinig of geen achtergrond van informatica. Belangrijkste kenmerken: implementatie van meerdere methoden voor gen-set-analyse: oververtegenwoordiginganalyse een op resampling gebaseerde methode die Gene-scores gebruikt een op de rang gebaseerde methode die Gene-scores gebruikt een op resampling gebaseerde methode die correlatie tussen genexpressieprofielen gebruikt (een type "cluster-verrijking" -analyse). Gene-sets ontvangen statistische scores (P-waarden) en meerdere testcorrectie wordt ondersteund. -ondersteuning van de genontologie-terminologie; Gebruikers kunnen kiezen welke aspecten worden geanalyseerd. Gebruikersbestanden gebruiken eenvoudige tekstindelingen -gebruikers kunnen gen-sets wijzigen of nieuwe maken. De resultaten kunnen worden gevisualiseerd in de software. Het is eenvoudig om meerdere analyses van dezelfde gegevens te vergelijken met verschillende instellingen. User-definuleerbare hyperlinks worden verstrekt aan externe sites om een efficiënter browsen van de resultaten mogelijk te maken. Voor programmeurs is er een opdrachtregelinterface en een eenvoudige applicatie-programmeerinterface die kan worden gebruikt om de EMMINEJ-functionaliteit in uw eigen code aan te sluiten

Erminej Gerelateerde software