Fasta Een snelle eiwit- of nucleotid-vergelijkingstoepassing
Download nu

Fasta Rangschikking & Samenvatting

Fasta Tags

vergelijking toegang Loop eiwit snel Sprintje Toegangsprogramma's Mijn toegang tot documenten nucleotide hete sleutels toegang tot documenten

Fasta Beschrijving

FASTA is een uitgebreide toepassingssuite die kan worden gebruikt voor snelle eiwit- of nucleotide-vergelijking. Dit programma behaalt een hoog niveau van gevoeligheid voor gelijkenis die op hoge snelheid zoekt. Dit wordt bereikt door geoptimaliseerde zoekopdrachten uit te voeren voor lokale uitlijningen met behulp van een substitutiematrix. De hoge snelheid van dit programma wordt bereikt door het waargenomen patroon van Word-hits te gebruiken om potentiële overeenkomsten te identificeren voordat u probeert de meer tijdrovende geoptimaliseerde zoekopdracht. De afweging tussen snelheid en gevoeligheid wordt gecontroleerd door de KTUP-parameter, die de grootte van het woord aangeeft. Het verhogen van de KTUP vermindert het aantal achtergrondhits. Niet elk woordje wordt onderzocht, maar in plaats daarvan zoekt in eerste instantie naar segment's met verschillende nabijgelegen hits.

Fasta Gerelateerde software