Fylonet Analyseer de evolutionaire relaties van het netwerken met deze toepassing.
Download nu

Fylonet Rangschikking & Samenvatting

Fylonet Tags

analyse overdracht Analyseren bouw relaties evolutionair proces Evolutionair algoritme creëer evolutionair algoritme Ontwikkel evolutionair algoritme evolutionaire boom specificeer evolutionair algoritme evolutionair Evolutionair onderzoekssysteem Evolutionaire berekening evolutionaire clade evolutionaire simulatie overdracht van genen Bewaar fylogenetisch netwerk simuleren evolutionaire genetica Evolutionaire Trace-methode Evolutionaire patroonanalyse Evolutionair Biology Tool Evolutionaire gegevensviewer Evolutionaire gegevens analyseren WSDL relaties relaties KEYMAN AMHARIC SOFTWARE aplikasi untuk bewerken www.nokia n72 software.com wifi wachtwoord cracker Chinese mobiele pc gratis te downloaden spel LG GD350 pc www.soft freez driver remover Weer Docklet Vista Schermrecorder goud Gratis antivirus-opstelling

Fylonet Beschrijving

Phylonet is een handig, eenvoudig te gebruiken hulpmiddel dat speciaal is ontworpen om gebruikers een reeks gereedschappen aan te bieden voor het reconstrueren en analyseren van reticulate (niet-treelike) evolutionaire relaties. In het bijzonder omvat het softwarepakket functies voor het afleiden van horizontale genoverdracht van een paar soorten / genbomen en het detecteren van intersspecifieke recombinatie-breekpunten in een sequentie-uitlijning. Verder heeft het de capaciteiten voor het lezen / opslaan van fylogenetische netwerken, en het vergelijken van fylogenetische netwerken topologieën. Naarmate de algoritmen voor fylogenetische netwerkreconstructie en evaluatie gebruikmaken van algoritmische technieken van het domein van fylogenetische bomen, bevat het pakket ook verschillende bomengerichte functies, zoals modules voor het berekenen van de maximale overeenkomst-subbomen, de Robinson-Foulds afstandsmaatregelen, enz. Belangrijkste kenmerken: MAD - MAXIMALE OVEREENKOMST SUBBRUIK RF - Robinson-Fouls / Symmetric Verschil Boom Meet RIATAHGT - een heuristiek voor het detecteren van HGT-evenementen van een paar soorten / genbomen LCA - Minimale gemeenschappelijke voorouder van een reeks knooppunten in een boom Recomp - een op venster gebaseerde methode voor het detecteren van intersspecifieke recombinatie breekpunten -karnet - een hulpmiddel voor het berekenen van clusters, bomen en tripartities in een netwerk CMPNETS - een hulpmiddel voor het berekenen van de afstand tussen twee netwerken Netpars - een hulpmiddel voor het scoren van de parminonie van fylogenetische netwerken COWEL - een hulpmiddel voor het vermelden van alle geldige coalescenario's van een gen in de takken van een soortstructuur GECPLEX - een hulpmiddel voor het genereren van een MILP-formulering die kan worden opgelost door CPLEX voor een soortbomen en een reeks genbomen Genst - een tool voor het genereren van soorten To-topoloties op basis van maximale sets compatibele clusters. Compute_st (deze tool is een PERL-script) - voor het reconstrueren van de soortstructuur van genbomen onder de coalcente. Infer_st - voor het afleiden van de soort boom van genbomen. Methoden omvatten MDC, MDC met tijd, glas, uitgebreide meerderheid consensus en democratische stemming. Deep_coal__Count - voor het tellen van het aantal extra lijnen bijgedragen door een reeks genbomen en soortbomen SIM_GTINNETWORK - voor het simuleren van genbomen onder het fylogenetische netwerkmodel in de Yu et al. SYST BIOL 2010 PAPIER

Fylonet Gerelateerde software