GCUA: Algemene Codon Gebruiksanalyse

Genanalyse Gemakkelijk gemaakt.
Download nu

GCUA: Algemene Codon Gebruiksanalyse Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • James O. McInerney
  • Besturingssystemen:
  • Windows All
  • Bestandsgrootte:
  • 82 KB

GCUA: Algemene Codon Gebruiksanalyse Tags


GCUA: Algemene Codon Gebruiksanalyse Beschrijving

GCUA: Algemene Codon-gebruikanalyse is handig, eenvoudig te gebruiken, op Java gebaseerde applicatie speciaal ontworpen om verschillende taken uit te voeren die van gebruik zijn voor het evalueren van Codon-gebruik in een reeks genen. Je kunt het krijgen om een aantal eenvoudige dingen te doen zoals het aantal observaties van een bepaald codon in een gen berekenen. Of je kunt hetzelfde doen voor de gecombineerde dataset. U kunt ook bekijken naar de gebruiksfrequenties van aminozuur (opnieuw voor elk gen of voor de dataset als geheel). Het programma produceert ook een afstandsmatrix op basis van de gelijkenis van codongebruik in genen. Het belangrijkste kenmerk van het programma is echter het vermogen om multivariate analyse te gebruiken om te kijken naar variatie in codongebruik onder genen. Hoewel het populair is om te zeggen dat een organisme een bepaald codon-gebruik heeft, is het nu bekend dat een organismengenen meer dan één codon-gebruikspatroon hebben en het meestal alleen is door een multivariate analysemethode te gebruiken die het mogelijk is om de soorten te bepalen van variatie in de gegevens.


GCUA: Algemene Codon Gebruiksanalyse Gerelateerde software