Genemir

Unified zoeken naar MicroMA-doelwitvoorspellingen van MicroMa.
Download nu

Genemir Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • Diva Tommei
  • Besturingssystemen:
  • Windows XP / Vista / 7
  • Bestandsgrootte:
  • 21.4 MB

Genemir Tags


Genemir Beschrijving

De Toepassing van Genemir Software is een tool gericht op biologen en bio-informatici die voorspelling en expressiepatronen in sets van Micrownas en genen willen vinden. Het programma werkt met muis- en menselijke doelvoorspelling en expressiegegevens. Een van de twee soorten query kan worden gemaakt door te selecteren: · Een of meer microïnen; · Een of meer genen of transcripties; respectievelijk verkrijgen: · Een lijst met genen voorspeld om gericht te zijn op de geselecteerde microhoorns; · Een lijst met Micrownas voorspeld om de geselecteerde genen en een complete lijst met genen te targeten die is gericht op die Micrownas. Elk van deze query's kan worden gewijzigd door de filters, waardoor de gebruiker een van de voorspellingsalgoritmen kan selecteren / deselecteren, en drempelcriteria opgeven die de reeks microRNA's of genen bepalen die zijn geretourneerd. Expressieniveaus van elk element in de uitgangsset evenals de gemiddelde uitdrukking van alle genen in die set kunnen worden beschouwd als een histogram. Histogrammen weergeven expressieniveaus in verschillende weefsels gemeten in de GNF Symatlas-dataset (zie sectie gegevenstypen), gemiddeld de expressiewaarden van elke probeset die hetzelfde gen vertegenwoordigen. Externe expressiegegevens kunnen ook op dezelfde manier worden geïmporteerd en bekeken (zie de sectie Expression Trend en Load Expression Data Section). Elk element in de resultatenset kan worden gekoppeld aan externe webbronnen. Elke lijst met genen in overeenstemming met het formaat dat wordt beschreven in het gedeelte Conversie Bestandsindeling kan worden verwerkt door de functie Convert ID's in een van de vier verschillende gen-ID's: Refseq, Gensy-symbool, GNF / Affymetrix en Ensembl. Geef GENEMIR een Probeer te zien hoe het echt in staat is!


Genemir Gerelateerde software