Gepasi Een softwaresysteem voor de simulatie van chemische en biochemische kinetiek
Download nu

Gepasi Rangschikking & Samenvatting

Gepasi Tags

simulatie scheikunde chemisch chemische simulatie biochemische kinetiek biochemische simulator

Gepasi Beschrijving

De Gepasi-applicatie is ontwikkeld om een softwaresysteem te zijn voor de simulatie van chemische en biochemische kinetiek. In deze sectie worden basisconcepten van (bio / chemische) kinetische modellen uitgelegd. U kunt dit gedeelte overslaan als u bekend bent met dit type modellering. Kinetische modellering gaat over het beschrijven van de evolutie van een systeem in de tijd. Een specifiek geval van kinetische modellering gaat over het vinden van een staat waarin het systeem stopt met evolueren in de tijd. Dergelijke staten worden stabiele staten genoemd. Bio / Chemical Kinetics behandelt de verandering van chemische concentraties met de tijd. De wiskundige beschrijving van de wijzigingen gebeurt via differentiaalvergelijkingen. Elke variabele metabolietconcentratie is dan een differentiële vergelijking en is samengesteld uit positieve (productie) en negatieve (vernietiging) bijdragen. Deze vergelijkingen staan bekend als balansvergelijkingen, vooral omdat de twee termen in evenwicht zijn in een stabiele toestand. De voorwaarden die elke balansvergelijking alleen samenstellen, beschrijven ook hoe de reactiesnelheden afhangen van de metabolietconcentraties. Dit betekent dat de verandering van één concentratie in het algemeen afhankelijk is van alle andere concentraties en daarom hebben we software nodig zoals Gepasi om numerieke oplossingen van deze vergelijkingen te produceren.

Gepasi Gerelateerde software