Hapevolution

Detecteert gen-gen-interacties van Case-Control HAPLOTYPE-gegevens
Download nu

Hapevolution Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • Memorial University of Newfoundland
  • Besturingssystemen:
  • Windows All
  • Bestandsgrootte:
  • 1.6 MB

Hapevolution Tags


Hapevolution Beschrijving

Complexe ziekten omvatten meerdere genen met lage penetratie die over het genoom kan worden verdeeld. De meeste van de huidige haplotype associatiemethoden zijn meestal in lengte beperkt en bestaan uit allelen van aangrenzende SNP's. Deze benaderingen hebben een beperkte capaciteit om epistasis te detecteren van meerdere genen-interacties. Recent bewijs heeft aangetoond dat de 3D-structuur van chromosomen een rol kan spelen bij het toestaan van SNP's om te communiceren met genetische elementen die fysiek gescheiden zijn door grote afstand. Hapevolution is een professionele toepassing die is ontworpen voor het implementeren van een coöperatief COVOLUTIONAIRE-algoritme (CCA) om genen-gen-interacties van Case-Control Haplotype-gegevens te detecteren; Bovendien kan dit algoritme tot 15% ontbrekende / dubbelzinnige posities verdragen in haplotype-gegevens die ontstaan tijdens haplotype-fasering van genotypen. Verder kan het algoritme epistatische associaties berekenen van genen die meerdere chromosomen overspannen.


Hapevolution Gerelateerde software