| Isoet Java-tool om u te helpen met uw onderzoek |
Download nu |
Isoet Rangschikking & Samenvatting
- Naam uitgever:
- Bioinformatics Lab
- Besturingssystemen:
- Windows All
Isoet Tags
Isoet Beschrijving
De ISOEM-toepassing is een op java gebaseerd gereedschap dat kan worden gebruikt om isoform- en genexpressieniveaus van high-throughput-transcriptome sequencing (RNA-SEQ) -gegevens af te leiden. Isoet gebruikt een nieuw verwachting-maximalisatie-algoritme dat leest disambiguatiegegevens die worden verstrekt door de verdeling van insteekgroottes die worden gegenereerd tijdens de voorbereiding van de sequencingbibliotheek, en profiteert van de scores van de basiskwaliteit, streng en leesinformatie. Empirische experimenten op synthetische gegevenssets tonen aan dat het algoritme aanzienlijk beter presteert dan de bestaande methoden van de schatting van het isovorm en het genexpressie-niveau van RNA-SEQ-gegevens.
Isoet Gerelateerde software