Jvirgel

Een software voor de simulatie en analyse van de gegevens van Proteomics
Download nu

Jvirgel Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • Karsten Hiller
  • Bestandsgrootte:
  • 33.7 MB

Jvirgel Tags


Jvirgel Beschrijving

Jvirgel is een krachtige toepassing die is ontworpen om de theoretische iso-elektrische punten (PI) en de berekende molecuulgewichten (MW) eiwitten te bepalen. Hiermee kunt u deze ook visualiseren als een virtuele tweedimensionale (2D) eiwitkaart. De gebruiker kan de presentatie van de berekende 2D-gel interactief besturen door een PI / MW-bereik en een elektroforetisch tijdschaal van belang te selecteren. Belangrijkste kenmerken: invoer van aminozuursequenties van FASTA-, EMBL-bestand of van Prodoric-database via XML voorspelling en visualisatie van secretomen voorspelling en visualisatie van membraan proteomen Vertaling van de Codon Adaptation Index (CAI) in Eiwit Spot Size Uitsluiting van membraaneiwitten uit de visualisatie Accounting voor signaalpeptiden en in Silico-splitsing die resulteert in een hogere voorspellingsnauwkeurigheid van de PI en MW export van virtuele gels naar PNG- of JPG-graphics matching van een experimentele gel met een virtuele gel met behulp van verschillende regressie-algoritmen Zoomt in een gebruiker selecteerbare PH / MW-bereik -eiwitten kunnen worden gesorteerd in groepen en alle gegevens kunnen worden geëxporteerd in CSV-tabellen of MS-Excel-spreadsheets -eiwitten kunnen worden gekleurd volgens hun inhoud van transmembraan-helices of hun waarschijnlijkheid om uitgescheiden te worden


Jvirgel Gerelateerde software

Over ons