Klauwen Classificeer uw reeksen met deze tool.
Download nu

Klauwen Rangschikking & Samenvatting

Klauwen Tags

bestand classificeren classificeren classificatie volgorde filmsequenties videofragmenten Classificeer bestanden classificeren lettertype Documenten classificeren e-mail indienen classificeren virus Gegevens indelen gedragssequenties classificeren microarray-gegevens analyseren polypeptidesequenties Polypeptidesequenties classificeren sequentie Metagenomische sequentiesanalyse metagenomische sequenties analyseren opeenvolgingen

Klauwen Beschrijving

Clams is een handige applicatie die speciaal is ontworpen om u een op volgelectie-compositie gebaseerde classifier voor metagenomische sequenties aan te bieden. Clams werkt door handtekeningen van elke sequentie vast te leggen op basis van de sequentiesamenstelling. Elke sequentie is gemodelleerd als een wandeling in een grafiek van de Bruijn met onderliggende eigenschappen van Markov Chain. Clams vangt stationaire parameters van de onderliggende Markov-keten, evenals structurele parameters van de onderliggende grafiek van de Bruijn om deze handtekening te vormen. In de praktijk wordt voor elke sequentie naar BINNED, een dergelijke handtekening berekend en aangepast aan vergelijkbare handtekeningen die voor de trainingssets worden berekend. De beste match die ook de genormaliseerde cut-off van de afstand kwalificeert. In het geval dat de beste overeenkomst deze cut-off niet kwalificeert, blijft de sequentie niet-begraven.

Klauwen Gerelateerde software