MCHEZA Detect dominante markers met deze Java-app
Download nu

MCHEZA Rangschikking & Samenvatting

MCHEZA Tags

werkbank markeerstift

MCHEZA Beschrijving

MCEZA is ontwikkeld als een toegankelijke en open source selectie Detection Workbench voor dominante markers. Het begrijpen van de bijdrage van selectie en moleculaire aanpassing bij het vormen van genoom brede variatie heeft veel toepassingen die variëren van de menselijke gezondheid tot het behoud van bedreigde soorten. MCEZA biedt een geïntegreerd platform om dominante markers voor selectie te testen. De applicatie combineert de DFDIST-kernel, een veelgebruikte FST-Continy-methode om selectie te detecteren met een intelligente, eenvoudig te gebruiken interface. Belangrijkste kenmerken: DFDIST - De kern van MCEZA is een dominante versie van een veelgebruikte FST-uitschietmethode om selectie te detecteren. Ondersteuning voor multitestcorrectie op basis van valse ontdekkingstarieven (FDR). Multitest correctie is fundamenteel om hoge overschatting van het percentage uitbijters te vermijden. Java Web Start-applicatie met een eenvoudig te gebruiken interface, direct bruikbaar vanaf het web. -gegevensimport in Genepop-indeling. -gegevensuitvoer naar R of gewoonlijk gebruikte spreadsheet-software. -vermogen om te kiezen welke populaties en / of loci worden bestudeerd. Gemiddelde neutrale fst benaderen door potentiële geselecteerde loci te verwijderen. Gemiddelde gemiddelde gesimuleerde FST-gesimuleerd op de gemiddelde waarde die op de echte dataset wordt aangetroffen, zelfs wanneer de experimentele omstandigheden ver van degenen zijn waar de theoretische formule vasthoudt (bijv. Laag aantal demes of het gebruik van het stapsgewijze mutatiemodel). iteratieve afvlakking van betrouwbaarheidsintervalcontouren. Generatie van publicatiekwaliteit Graphics in verschillende indelingen (PNG, SVG en PDF) Mogelijkheid om meerdere CPU-kernen te gebruiken bij het uitvoeren van DFDIST.

MCHEZA Gerelateerde software