MSATCommander Microsatellite-herhalingen lokaliseren, locus-specifieke primers, en tag ze
Download nu

MSATCommander Rangschikking & Samenvatting

MSATCommander Tags

herhalen primer ontwerp primer biologische herhalingen microsatelliet DNA Microsatellite Herhaalzoeker tag primer microsatelliet Ziekte gevoeligheid locus Groot-microsatellite-gegevensset Microsatellite Analyzer Vind geneste tandem herhalingen vind microsatellietmarkers Microsatellite Markers Finder ontwerp primers Detect DNA-herhalingen DNA herhaalt detectie

MSATCommander Beschrijving

MSATCommander is een Python-programma dat is geschreven om Microsatellite (SSR, VNTR, C) te lokaliseren binnen fasta-geformatteerde sequentie- of consensusbestanden. MSATFINDER ZAL ZOEKEN ALS ALLE DI-, TRI-, TETRA-, PENTA- EN HEXA-Nucleotide-herhalingen (met opties om te zoeken naar minder herhalingstypen en combinaties van herhalingstypen). Geef MSATCommander A Probeer zijn capaciteiten volledig te beoordelen! Belangrijkste kenmerken: zoekt naar alle mono-, di-, tri-, tetra-, penta- en hexanucleotide-herhalingen herhalingen kunnen worden gecombineerd over door de gebruiker opgegeven afstanden (BP) Designs Primers voor gevestigde herhalingen -tags en test primers met M13R, CAG, of aangepaste tag. De 'beste' primer wordt gerapporteerd aan de gebruiker voegt GTTT-pigtails toe aan de niet-getagde, 'Beste' Primer gerapporteerd aan de gebruiker biedt een handige GUI voor een meerderheid van de gebruikers Uitgangen resultaten in CSV-indeling, voor eenvoudige invoer naar spreadsheet-software

MSATCommander Gerelateerde software