Magische gereedschap

Microarray Genome Imaging and Clusting Tool
Download nu

Magische gereedschap Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • GPL
  • Naam uitgever:
  • Laurie Heyer
  • Besturingssystemen:
  • Windows All
  • Bestandsgrootte:
  • 17.1 MB

Magische gereedschap Tags


Magische gereedschap Beschrijving

Magic Tool is een op Java gebaseerde Windows-toepassing waarvan het doel is om u te helpen DNA-microarray TIFF-bestanden en procesvergelijkende hybridisatiegegevens (glazen chips) en Affymetrix-informatie te analyseren. Portable Running Modeyou kan profiteren van het feit dat het gereedschap in een draagbaar pakket is en implementeer het direct op uw computer zonder door een installatieproces te hoeven gaan. Bovendien wordt uw Windows-register niet opgeblazen met onnodige inzendingen. U kunt het opslaan op een USB-flashdrive of andere apparaten en het u opnemen. Gebruikersinterfacemagic tool adopteert een schone lay-out waarmee u bestanden in de werkomgeving kunt toevoegen met behulp van de ingebouwde browse-knop (er is geen ondersteuning voor slepen-en-druppel). U kunt een voorbeeld van de inhoud van het bestand bekijken, deze onderzoeken met behulp van de zoom- en uit-functies, passen in de afbeelding naar het scherm, de linker- en rechtervlekken instellen, de onderste rij opgeven, evenals het aantal rijen en kolommen aanpassen. Het definiëren van nieuwe projecten De applicatie maakt gebruik van projecten voor het opslaan van details en configuratie-instellingen over de geïmporteerde gegevens en uitgevoerde berekeningen. Projecten kunnen worden opgeslagen en toegevoegd voor toekomstige bewerkingstaken. U kunt items importeren met verschillende bestandsindelingen (TXT, JPEG, TIF, GIF, Net, Info of Flag), de inhoud van een volledige map toe te voegen, bestanden in de projectmap in te voegen en het project bij te werken (de aanpassingen worden automatisch toegepast), Naast de rode en groene TIFF-beeldparen. Bovendien kunt u de genielijst laden en een nieuw raster maken of een opgeslagen toevoegen. Als het gaat om het maken van netcreatie, kunt u het totale aantal rasters in het TIFF-bestand invoeren, de spotoriëntatie in de roosters (horizontaal of verticaal) opgeven, het contrast aanpassen om zwakke plekken, het middenstroom-raster in te lichten, Met behulp van drie klikken (linksboven en rechtervlekken en onderste rij instellen), stel het rooster in op het middenslaspunten, maak meerdere rasters en vlag problematische vlekken (optioneel). Onderscheid signaal van ruis, genereer een reeks clusters en moremagic tool geeft u de mogelijkheid om het signaal van de achtergrond te onderscheiden en expressiebestand te genereren. U kunt kiezen tussen verschillende methoden voor het onderscheiden van het signaal van de achtergrond, namelijk gefixeerde of adaptieve cirkel, gebeëde regio-optie (ontworpen voor het vinden van het signaal voor elke plek op basis van de verdeling van het signaal) of verhouding methoden (rode voorgrond en achtergrond of groen voorgrond en achtergrond om de verhouding voor elke functie op de microarray te bepalen). Bovendien kunt u meerdere stappen herhalen voor experimentele omstandigheden in uw studie, manipuleren gegevens (transformatie, normaliseren, beperkende gegevens, filter of scramble), voeg gene info toe aan expression-bestand, filter uw gegevens door onnodige genen te verwijderen, de ongerijst te verwijderen, De verschillen tussen elk paar genexpressiepatronen), genereren een reeks clusters, bouwen een lijst met taken op die in volgorde moeten worden uitgevoerd en vergelijken de gevolgen van verschillende keuzes voor het kwantificeren, vergelijken en clusteren van dezelfde onbewerkte dataset. BUTOM LINEALL In totaal blijkt magische tool een betrouwbaar hulpmiddel dat kan worden gebruikt als een krachtig onderwijsinstrument om studenten te helpen DNA Microarray TIFF-bestanden te verkennen en te verwerken. Beoordeeld door Ana Marculescu, laatst bijgewerkt op 20 oktober 2014


Magische gereedschap Gerelateerde software