Mesa

Hiermee kunnen datasets worden gemanipuleerd in geavanceerde manieren
Download nu

Mesa Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • Paul-Michael Agapow
  • Besturingssystemen:
  • Windows All
  • Bestandsgrootte:
  • 1.2 MB

Mesa Tags


Mesa Beschrijving

Phylogenies zijn guns. Een evolutionaire geschiedenis draagt in zijn vorm de vingerafdrukken van elk proces dat zijn creatie bewerkstelligt: uitsterving, belangrijke aanpassingen, stralingen, kolonisaties, veranderingen in het tempo en de modus van macroevolutie. Helaas is het analyseren van fylogenies moeilijk. De berekeningen van interesse voor elke onderzoeker zijn soms ingewikkeld en arbeidsintensief. Ze zijn ook vaak in verschillende programma's, als er überhaupt een software-implementatie is. De statistische significantie van resultaten vereisen vaak de vergelijking van honderden tot duizenden bomen. Ten slotte kunnen metrics kwetsbaar zijn voor de ontwikkelingsmodus, groeide een fylogenie onder. Het resultaat van deze problemen is dat fylogenetische analyse vaak hard werken is, en het is moeilijk om te weten wat te maken van de antwoorden. De MESA-applicatie is ontworpen om deze problemen te verlichten. Hoewel Mesa echt slechts vier dingen doet, is de grote overwinning voor onderzoekers dat al deze in het ene softwarepakket zijn en kunnen worden gebruikt in combinatie met elkaar en semi-geautomatiseerd. Aldus worden de problemen van het overbrengen van gegevens tussen programma's en mogelijke corruptie of verkeerdepretatie van resultaten vermeden. Belangrijkste kenmerken: Manipulaties: Mesa laat datasets in geavanceerde manieren worden gemanipuleerd. Phylogenetische bomen en levensgeschiedeniskenmerken kunnen worden bewerkt, gedupliceerd of verwijderd. Taklengten kunnen systematisch worden gewijzigd, taxa verwijderd volgens complexe omstandigheden, kenmerkend gewijzigd en selectief gewijzigd. De hele dataset kan ook worden ondersteund en op elk moment gerestaureerd. -analyses: MESA bevat een groot aantal berekeningen die diversiteit in een fylogenie (bijv. Phylogenetische diversiteit), diversiteit tussen gemeenschappen (bijv. SHANCO-Weiner-index), maatregelen van macroevolutionair proces (bijv. FUSCO-CRONK-onevenwichtigheid), kunnen (bijv. over taxa (bijv. SIMULATIES: MESA maakt het mogelijk dat fylogenies worden gekweekt onder geavanceerde scenario's waar speciatie- en uitstervenspercentages kunnen worden bewerkstelligd door de eigenschappen van de betrokken taxa of globale attributen van de fylogenie. Simulaties kunnen verder worden versierd door massa-uitsterving en de evolutie van de eigenschappen van de levensgeschiedenis. Automatisering: Om de productie en het testen van een groot aantal fylogenieën mogelijk te maken, kunnen MESA gebruikersketens van acties (manipulaties, analyses en simulaties) construeren die kunnen worden uitgevoerd als een enkele eenheid, loopt over groepen opdrachten, opslaan en herstellen gegevens. Zo kan men gemakkelijk testen genereren een groot aantal replicaties voor statistische geldigheid.


Mesa Gerelateerde software