Musite Nog een andere bio-informatica-tool om u te helpen met uw werk.
Download nu

Musite Rangschikking & Samenvatting

Musite Tags

rekenmachine berekenen eiwit bioinformatica visuele platform bio-informatica bioinformatica bibliotheek Bioinformatics Tool bioinformatics gui Bioinformatics-pakket bioinformatics workflow P2P Bioinformatics Service Bioinformatics Service bioinformatica probleem UCSC genoom bioinformatica omgaan met bio-informaticagegevens Bioinformatics Toolkit Bioinformatics Data Warehouse

Musite Beschrijving

MOSITE is een gemakkelijk te gebruiken, op Java gebaseerde applicatie die is ontworpen om een bio-informatica-tool te bieden voor het voorspellen van zowel algemene als kinase-specifieke eiwitfosforylatiesites. Belangrijkste kenmerken: om de verschillende beperkingen van huidige tools aan te pakken bij het aanbrengen van proteomen en om de grote omvang van experimenteel geverifieerde fosforylatiegebied te gebruiken, hebben we een unieke zelfstandige applicatiesysteem Musite, speciaal ontworpen voor grootschalige voorspelling van beide algemeen ontwikkeld en kinase-specifieke fosforylatiesites. MOSITE GEBRUIKT LOKALE SEQUENTIE Gelijksoortige patronen (KNN-scores) en generieke kenmerken (stoornissencores en aminozuurfrequenties) van fosforylatiesites, en werkten een uitgebreide machine-leerbenadering om voorspellingen te doen. We hebben de vorige bevinding bevestigd dat fosforylatiesites bij voorkeur zijn gelegen in ongeordende regio's op fosfoproteomics-gegevens in zes organismen. Musite is de eerste tool die hulpprogramma biedt voor het trainen van een voorspellingsmodel voor fosforylatie-site van de eigen gegevens van gebruikers en ondersteunt continue aanpassing van stringcijfers. MOSITE biedt een gebruiksvriendelijke grafische gebruikersinterface, waardoor het gemakkelijk is om biologen om voorspellingen op een geautomatiseerde manier uit te voeren. -toepassingen van MOSITE op zes proteomen leverden tienduizenden vermeende fosforylatielocaties met een hoge stringentie op. Deze voorspellingen bieden nuttige hypothesen voor experimentele validaties. Cross-validatietests tonen aan dat musite significant presteert dan bestaande instrumenten voor het voorspellen van algemene fosforylatiesites en is op zijn minst vergelijkbaar met die voor het voorspellen van kinase-specifieke fosforylatiesites. Bovendien, als open-source-software, kan MUSITE ook worden geserveerd als een open platform voor het bouwen van machine-leeraanvraag voor de voorspelling van fosforylatie-site.

Musite Gerelateerde software