OPSM MINER Tabblad gescheiden ASCII-bestand
Download nu

OPSM MINER Rangschikking & Samenvatting

OPSM MINER Tags

ASCII mijnwerker genexpressie AutoCAD 2004 Facebook chat-applicatie pic aapfoto C2-00 Size Watch pub fi Mega Miner Game HP SE Goudzoeker downloaden super mijnwerker spel goud mijnwerker 7 mijnwerkeroorlogen eenvoudige mijnwerker sterminer Antivirus crack-versie Morpheus Deutsch

OPSM MINER Beschrijving

Dit pakket biedt een OPSM-mijnwerker en het informatieproject. Invoer - Tab-gescheiden ASCII-bestand. Rijen zijn weefsels, kolommen zijn genexpressies. Een rij kan een koperkolom bevatten en hun kan een header rij zijn. In elk geval moet het aantal kolommen gelijk zijn aan alle rijen. - Een header rij en kolom kunnen elke reeks bevatten, alle andere waarden moeten nummers bevatten. - Matrixgrootte is T (weefsels) x g (genexpressies). Algorithms en vlaggen Het algoritme voert DFS-verticale vergelijking uit, wat betekent dat twee genexpressies worden vergeleken. - "gebruik in-core dualvergelijking" - Pre-build alle paren van uitdrukkingen vectoren, dit zou GXGXT-maat in het geheugen nemen, dus zorg ervoor dat het in het geheugen kan passen. - "Ondersteuning" - het aantal weefsels dat een patroon bevat. Stel de applicatiesteun in voor dit minimale aantal weefsels dat u het patroon wilt bevatten dat u zoekt. Het instellen van een zeer hoog getal levert heel weinig patronen op, zeer laag aantal - en de mijnbouw kan niet eindigen (exponentieel aantal patronen). - "min lengte", "max lengte" - de patronenformaat waarnaar u op zoek bent. Stel "MIN-lengte" in, zodat de toepassing niet erg korte en niet interessante patronen zal retourneren. Stel "MAX-lengte" in om de looptijd te verminderen. - "MAX FOUTEN" - Alleen voor OPSM met fouten. OPSM zoekt naar exacte patronen. OPSM met fouten tellen een weefsel, zelfs als het een x aantal genen bevat dat niet bij het patroon past. - "Max Group Len" - Voor OPSM met groepen wordt het patroon vergeleken tussen groepen genen in plaats van afzonderlijke genen. Het patroon zal bijvoorbeeld zijn: (0,40,60,4) (0,70,8) (0.90,95) - "Max Layer Diff" - Onthoud het niet ... hoe u OPSM gebruikt met lagenalgoritme Bij het instellen op lagen moet een lagendefinitie-bestand zijn met dezelfde naam als het dataset-bestand, toegevoegd met ".layers". Bijvoorbeeld: Saltdat.txt Saltdat.txt.layers Bestandsformaat - Elke regel vertegenwoordigt een laag. Elke laag is een reeks kolommen: 0-56-10 ... ...

OPSM MINER Gerelateerde software