Ontomine Ontomine is een datamining-software die wordt gebruikt voor geautomatiseerde moleculaire mijnbouw voor bioactiviteit, toxiciteit en voorspelling van de bijwerking. Ontomine is gebaseerd op experimenteel bepaalde eigenschappen van ongeveer 100.0
Download nu

Ontomine Rangschikking & Samenvatting

Ontomine Tags

moleculair Moleculaire evolutie moleculaire afbeeldingen Gegevenswinning mijnbouw mijnbouwmotor visualiseer moleculaire structuren moleculaire modellering moleculaire geometrie moleculaire rekenmachine Process Mining moleculaire structuur Tekstwinning moleculaire kijker moleculaire View Moleculaire descriptor Moleculaire machine Molecular Dynamics-pakket Moleculaire interactienetwerken moleculair model moleculaire visualisatie moleculaire editor moleculaire modeller moleculair schetsen Moleculair orbitaal moleculaire analyse moleculair ontwerp Moleculaire ontwerper Interactieve volgorde mijnbouw Moleculaire mijnbouw Bio-activiteitstest mijnbouwtool tekst mijnbouwplatform tekst mijnbouw algoritme Simuleer moleculaire dynamiek moleculaire diameter Molecular Simulation moleculaire afbeelding Moleculair systeem Zoek moleculaire onderbouw Moleculaire vertegenwoordiging Moleculaire dynamiek Moleculaire simulator Animate Molecular Trajectory moleculair oppervlak Moleculaire topologie Moleculaire fylogenie neutraal moleculair moleculaire sequentie Moleculaire fylogenetica Volgorde mijnbouw CDK-moleculaire descriptor moleculaire 3D-viewer

Ontomine Beschrijving

Een gegevensmijningssoftware die wordt gebruikt voor geautomatiseerde moleculaire mijnbouw voor bioactiviteit Ontomine is een gegevenswinningssoftware die wordt gebruikt voor geautomatiseerde moleculaire mijnbouw voor bioactiviteit, toxiciteit en voorspelling van de bijwerking. Ontomine is gebaseerd op experimenteel bepaalde eigenschappen van ongeveer 100.000 diverse kleine moleculen, verzameld uit databases, encyclopedieën en andere literatuur gevolgd door deskundige handcuratie. Deze dataset is geformuleerd in hiërarchische bomen bestaande uit enkele duizenden klassen bioactiviteiten, drugsdoelen, therapeutische gebieden, nadelige effecten en toxiciteiten. Elke klasse wordt vertegenwoordigd door een vingerafdruk voor de gerelateerde moleculen voor hun moleculaire eigenschappen, zoals aanwezigheid / afwezigheid / tellingen van zijkettingen / chemische activiteiten, ringstructuren enz. Ontomine en vergelijking met andere bestaande methoden Andere momenteel gebruikte bioactiviteit Voorspelling benaderingen kunnen worden ingedeeld in drie categorieën: * Grafiek theoretische en substructuur, topologische en fysische chemische chemische beschrijvingen * Maximale gemeenschappelijke onderbouw, vingerafdrukken overeenkomsten en machineerleermethoden * ATOM-wijkmethoden Deze methoden zijn momenteel echter beperkt door factoren zoals afstandsstoffers, cut-offs die niet representatief zijn voor activiteit, moeilijk om QSAR-modellen op verschillende niveaus te bouwen, b.v. drugsdoelen, bio-processen en therapeutisch gebied, evenals interpretatie van resultaten. Ontomine (gepatenteerd) is alternatief voor deze methoden, het transformeren van de structurele informatie voor chemisch, biologisch of farmacologisch gerelateerde moleculen tot een hiërarchisch schema van concepten en descriptors. Ontomine ontdekt patronen in het gerelateerde schema en voorspelt biologische activiteit, met behulp van regels afgeleid uit het analyseren van de patronen. Een significant voordeel van Ontominale algoritmen is dat ze schavingshoppen mogelijk maken, omdat de kernsteiger niet wordt geconserveerd wanneer patronen die kenmerkend zijn voor een activiteit die wordt ontdekt. Ontominente patronen vertegenwoordigen "noodzakelijk, maar niet voldoende" omstandigheden voor bioactiviteit, ongeacht een scaffold. Expliciete scaffoldhoppen kan worden uitgevoerd door constitutionele isomeren te genereren en interessante moleculen te selecteren met behulp van de regelsbasis. De resultaten van Ontomine worden gepresenteerd als eenvoudige begrijpelijke patronen die representatief zijn voor activiteit. Verder zijn ondominale voorspellingen schaalbaar voor miljoenen moleculen. Bovendien kunnen de samengestelde ontstanden datasets worden bijgehouden met interne datasets met gemeten molecuulactiviteiten van in-house samengestelde collecties.

Ontomine Gerelateerde software