Orfprimer Primer Design eenvoudig gemaakt via deze Java-tool
Download nu

Orfprimer Rangschikking & Samenvatting

Orfprimer Tags

ontwerp ontwerper volgorde eiwitsequentie primer ontwerp sequentie-zoeker

Orfprimer Beschrijving

Orfprimer is een op Java gebaseerde software die speciaal is gemaakt voor automatische primerontwerp. Het is gebaseerd op onze eerder vrijgegeven software-orfer die het Genbank XML- en Fasta-sequentie-formaat leest. Eiwitsequenties worden meestal gedownload door simpelweg de GI-ID of het toetredingsnummer van het overeenkomstige eiwitdoel te specificeren. Orfer haalt het open leesframe uit de gevraagde eiwitsequenties en geeft deze weer. Orfprimer berekent automatisch PCR-primers voor deze sequenties. De afhandeling van Orfprimer is intuïtioneel en vrij eenvoudig met behulp van de standaardinstellingen. Bovendien biedt het vele mogelijkheden om de berekeningsopties te wijzigen vóór en ook na de berekening van de primers, zoals: · Verschuiving van de positie van de primers, · Verandering van de gewenste smelttemperatuur, · Wijziging van de restrictieplaatsen in de primerssequenties. Op deze manier combineert Orfprimer gemak en aanpassingsvermogen in één programma dat het een krachtige softwaretool maakt.

Orfprimer Gerelateerde software