| Sammel SAM-bestanden verwerken met deze applicatie. |
Download nu |
Sammel Rangschikking & Samenvatting
- Naam uitgever:
- Guorong Xu
Sammel Tags
Sammel Beschrijving
Sammote is handig, eenvoudig te gebruiken Tool speciaal ontworpen voor het snel verwerken van SAM-bestanden om enkele van meer standaardprocedures in RNA-SEQ-gegevensanalyse te automatiseren. Met behulp van standaard- of aangepaste annotatiebestanden, zorgt ervoor dat gebruikers de korte leesdekking voor alle genomische tussenpozen nauwkeurig kunnen berekenen. Vooral voor RNA-SEQ-gegevens berekent Sammaat nauwkeurig de overvloed van genexpressie voor eventuele aangepaste genomische intervallen door het gebruik van korte lezing afkomstig uit zowel exons- als exon-exon-junctions. Sameleer ook snel berekent een hele genoomsignaalkaart aan de basis-wise resolutie, wat de vereiste invoer is voor het oplossen van een reeks bio-informatica-problemen. SAMMATE Exporteert een wiggle-bestand voor uitlijningsvisualisatie in de UCSC-genoombrowser en een verslag uit de uitlijnstatistieken. Sammote is compatibel met zowel enkelvoudige en gepaarde-end sequencing-technologieën. Belangrijkste kenmerken: Het berekenen van genomic-abundante score met behulp van RNA-SEQ-gegevens Signaalkaart genereren voor piekdetectie Wiggle-bestanden genereren voor visualisatie het genereren van uitlijningsrapport Pas Gene Annotation-bestand aan Personaliseer chromosoomnaam in uitvoerbestand
Sammel Gerelateerde software