Sammel

SAM-bestanden verwerken met deze applicatie.
Download nu

Sammel Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • GPL
  • Naam uitgever:
  • Guorong Xu
  • Bestandsgrootte:
  • 40 MB

Sammel Tags


Sammel Beschrijving

Sammote is handig, eenvoudig te gebruiken Tool speciaal ontworpen voor het snel verwerken van SAM-bestanden om enkele van meer standaardprocedures in RNA-SEQ-gegevensanalyse te automatiseren. Met behulp van standaard- of aangepaste annotatiebestanden, zorgt ervoor dat gebruikers de korte leesdekking voor alle genomische tussenpozen nauwkeurig kunnen berekenen. Vooral voor RNA-SEQ-gegevens berekent Sammaat nauwkeurig de overvloed van genexpressie voor eventuele aangepaste genomische intervallen door het gebruik van korte lezing afkomstig uit zowel exons- als exon-exon-junctions. Sameleer ook snel berekent een hele genoomsignaalkaart aan de basis-wise resolutie, wat de vereiste invoer is voor het oplossen van een reeks bio-informatica-problemen. SAMMATE Exporteert een wiggle-bestand voor uitlijningsvisualisatie in de UCSC-genoombrowser en een verslag uit de uitlijnstatistieken. Sammote is compatibel met zowel enkelvoudige en gepaarde-end sequencing-technologieën. Belangrijkste kenmerken: Het berekenen van genomic-abundante score met behulp van RNA-SEQ-gegevens Signaalkaart genereren voor piekdetectie Wiggle-bestanden genereren voor visualisatie het genereren van uitlijningsrapport Pas Gene Annotation-bestand aan Personaliseer chromosoomnaam in uitvoerbestand


Sammel Gerelateerde software

Voroprot

Een hulpmiddel voor de analyse van geometrische kenmerken van eiwitstructuur ...

160 8.6 MB

Downloaden

Dr. Shakes

Een geanimeerde weergave van een vibrerende structuur samen met de bijbehorende modi en fasen. ...

351 280 KB

Downloaden