Satellotyper HAPLOTYPE-inferentie van onfeileerde SNP-gegevens in heterozygote polyploïds op basis van SAT
Download nu

Satellotyper Rangschikking & Samenvatting

Satellotyper Tags

inferentiemachine Fuzzy gevolgtrekking systeem mijn SNP-site SNP-site analyseren HAPLOTYPE-schatting schatting haplotype Gemeenschappelijk haplotype teken haplotype verf haplotype haplotype SNP-merkers Snurk tag SNP genotype variatie-inferentie gevolgtrekking haplotype boom haplotype gevolgtrekking Booleaanse operator heterozygote polyploïd heterozygoot Gevolgtrekker SNP-zoekopdracht SNP downloaden filter SNP Analyse SNP-microarrays Phylogeny-inferentie Beschrijf haplotype Volgorde naar haplotype HAPLOTYPE-analyse Haplotype-blokanalyse HAPLOTYPE Associatietest grote fylogeny-inferentie SNP-identificatie haplotype associatie HAPLOTYPE-gegevens Y-chromosomaal haplotype Affymetrix SNP-arrays

Satellotyper Beschrijving

Satlotyc is een softwaretool die is ontworpen voor het afleiden van haplotypes van polyploïde en polyallelle onfased SNP-gegevens. Satlotyper gebruikt Boolean-operators en variabelen om Haplotype-gevolgtrekking te formuleren door pure parmsimonie (HIPP) voor het Boolean-bevredigingsprobleem (SAT). Voor het vinden van de meest parmonieuze reeks van het uitleggen van haplotypes, begint de satlotyciter met het uitgaan van een verklaring van haplotype en het aantal haplotypen verhoogt totdat een bevredigende set wordt gevonden. Aangezien SAT NP-compleet is, kan het niet worden gegarandeerd dat een oplossing wordt gevonden in een redelijke termijn voor een bepaalde gegevens. Empirische tests toonden echter aan dat het mogelijk is om gevolgtrekkingen voor gegevens uit de echte wereld te berekenen. Bovendien geeft SATLOTYPER beperkingen voor alternatieve uitlegoplossingen en is in staat om de waarschijnlijkheid van het resultaat te optimaliseren door middel van een bootstrappingsprocedure. Geef Satlotyper een Probeer te zien hoe nuttig het kan zijn voor jou!

Satellotyper Gerelateerde software