Savant Genome Browser

Bekijk genome-gegevens met deze tool.
Download nu

Savant Genome Browser Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • Freeware
  • Naam uitgever:
  • Computational Biology Lab
  • Bestandsgrootte:
  • 33.4 MB

Savant Genome Browser Tags


Savant Genome Browser Beschrijving

Savant Genome Browser is handig, gemakkelijk te gebruiken, op Java gebaseerde visualisatie-applicatie speciaal ontworpen voor genomische gegevens. Het werd voornamelijk ontwikkeld voor het visualiseren van hoge doorvoer (AKA volgende generatie) sequentiegegevens, hoewel het kan worden gebruikt om vrijwel elke genoom-gebaseerde sequentie, punt, interval of continue dataset te visualiseren. Belangrijkste kenmerken: FASTA, bed, SAM / BAM, WIG, GFF en vrijwel elk tabblad Gescheiden tekstbestand met positionele annotaties Snelle gegevenstoegang Schaalbaar voor zeer grote invoerbestanden kleine geheugenvoetafdruk zoomen, pannen en zoeken naar bereikbesturingen of toetsenbord en muis Dockable modules ondersteunende show / hide, herschikking, maximaliseren, zweven, sluiten Compacte weergave van sequentie, punt, interval en continue tracks Meerdere displaysmodi voor specifieke tracktypen werkt op Windows, Linux, Mac en elk ander platform met ondersteuning voor Java Virtual Machine Plugin Framework biedt toegang tot gegevens, tracks en UI voor uitgebreide maatwerk Bookmarking van locaties Track vergrendeling Nieuwe weergave van gepaarde uiteinde leest het maken van structurele variaties gemakkelijk te identificeren


Savant Genome Browser Gerelateerde software