Sbmlsqueezer Kinetische vergelijkingen genereren voor biochemische netwerken
Download nu

Sbmlsqueezer Rangschikking & Samenvatting

Sbmlsqueezer Tags

generator biochemisch

Sbmlsqueezer Beschrijving

SBMLSqueezer genereert kinetische vergelijkingen voor biochemische netwerken volgens de context van elke reactie. Bij gebruik als plug-in voor Celldesigner gebruikt het de informatie van de SBGN-weergave van alle netwerkcomponenten. In de stand-alone modus evalueert SBMLSQUEEZE de annotaties van de systemen Biology Ontology (SBO) om deze informatie te extraheren. De tariefwetten die kunnen worden geproduceerd door SBMLSqueezer omvatten verschillende soorten gegeneraliseerde massa-actie; Gedetailleerde en gegeneraliseerde enzymkinetiek, verschillende soorten heuvelvergelijkingen, S- en H-systemen en additieve modellen voor gen-verordening. Door de gebruiker gedefinieerde instellingen Geef aan welke vergelijking een vergelijking is voor elk type reactie en hoe u eenheidsconsistentie van het model kunt waarborgen. Vergelijkingen kunnen worden gemaakt met behulp van contextuele menu's. Alle nieuw gemaakte parameters zijn uitgerust met de afgeleide eenheid en geannoteerd met SBO-termen indien beschikbaar en zinvolle tekstuele namen. MathML wordt rechtstreeks in het SBML-bestand geplaatst. Latex of tekst export van gewone differentiaalvergelijkingen is aanwezig. Geef SBMLSqueezer een poging om zijn mogelijkheden volledig te beoordelen!

Sbmlsqueezer Gerelateerde software