Seq-gen Simuleert de evolutie van nucleotide of aminozuursequenties
Download nu

Seq-gen Rangschikking & Samenvatting

Seq-gen Tags

simulator volgorde zuur Zure titratie nucleotidevenredance zuur lettertype sleutelcode Zure transactie nucleïnezuuranalyse nucleotidesequentie nucleotidesequentiemanager nucleotide evolutie simuleren vind aminozuur aminozuurzoeker aminozuur zoeken Aminozuuranalysator Aminozuursequentie aminozuur aminozuur vertaler zuur thema Extract-aminozuur zuuroplossing aminozuurresidu optimaal aminozuur Nucleotide-substitutiemodel nucleotide motief nucleïnezuursequentie Substitutie van nucleotide Nucleotide-annotatie Nucleotide-uitlijning Analyse aminozuur Nucleïnezuur analyseer het aminozuurpaar aminozuren paar analyse Aminozuursequentie-analyse analyseer aminozuursequentie aminozuurclassificatie Aminozuur topologie evaluatiesimulator Amino-zure detector detecteren aminozuur nucleotide polymorfismen Nucleotide-mutatie nucleotide fractie analyseren aminozuurketen zuurlussen Zure transacties hotmail password cracker zure pro ACID PRO 7 spelletjes applicatie Engelse Albanië machine bubbels on line Inkjet-printer C3125 sms-bericht AIM PRO VOOR seq water glock 26 gen Transformar ISO EM Creditcard Gen Sun Practice Examens umd gen

Seq-gen Beschrijving

SEQ-gen werd ontwikkeld om een programma te zijn dat de evolutie van nucleotide of aminozuursequenties langs een fylogenie zal simuleren, met behulp van gemeenschappelijke modellen van het substitutieproces. Een reeks modellen van moleculaire evolutie wordt geïmplementeerd, inclusief het algemene omkeerbare model. Staatsfrequenties en andere parameters van het model kunnen worden gegeven en locatiespecifieke heterogeniteit van de snelheid kan ook op een aantal manieren worden opgenomen. Elk aantal bomen kan worden gelezen en het programma produceert elk aantal gegevenssets voor elke boom. Aldus kunnen grote sets repliceren simulaties eenvoudig worden gemaakt. Het is ontworpen om een algemene simulator te zijn die de meeste van de algemeen gebruikte (en computationaal tractabele) modellen van moleculaire sequentie-evolutie omvat. SEQ-GEN is een opdrachtregelbesturingsprogramma dat in ANSI C is geschreven. Het moet eenvoudig worden samengesteld en uitgevoerd op elk Unix-systeem of werkstation. Dit artikel beschrijft het gebruik van SEQ-GEN op een Unix-machine. De toepassing vereist een hoeveelheid geheugen evenredig met de grootte van elke gesimuleerde sequentiegegevensset. SEQ-GEN uitvoeren Om SEQ-GN uit te voeren, typt u: SEQ-GEN <> Wanneer de parameters voor het programma zijn (hieronder beschreven), is het TOER-bestand en is de naam van het bestand dat de gesimuleerde sequenties bevat. Het Tree-bestand moet een of meer bomen in Phylip-indeling bevatten. De sequenties geproduceerd door SEQ-GEN zijn geschreven naar de standaarduitvoer (en kunnen dus worden doorgestuurd naar het uitvoerbestand met> ). Andere informatie en resultaten zijn geschreven naar de standaardfout en verschijnen dus op het scherm.

Seq-gen Gerelateerde software