Simba SIMBA - Ontdek het gedrag van uw favoriete gen of sets genen
Download nu

Simba Rangschikking & Samenvatting

Simba Tags

analyse gen Genome Genoomanalyse Genanalyse Analyseer Gene

Simba Beschrijving

De Simba Yeast-site biedt interactieve verkenning van een grootschalig compendium van gegevens van diverse hoge doorvoerexperimenten. U kunt het gedrag van uw favoriete gen of sets van genen verkennen, de activiteit van verschillende functionele modules in verschillende experimentele omstandigheden vergelijken of de relaties tussen genexpressieprogramma's, eiwitinteracties en transcriptiefactor bindende profielen testen. Simba's algoritme verdeelt genen en eigenschappen (meestal eenmalig punt of toestand in een experiment zoals een DNA-microarray) in bi-clusters ("BICS") die bestaat uit genen en eigenschappen zodanig dat de genen zich op dezelfde manier gedragen in die groep voorwaarden. BICS kan overlappen (in genen, omstandigheden of beide) en een gen kan in verschillende BICS aanwezig zijn, omdat het vergelijkbaar is met één groep genen onder omstandigheden A-G en aan een andere reeks genen onder omstandigheden H-M. Eigenschappen kunnen alles zijn van genoom-brede experimenten: niveau van RNA-expressie, doet of niet communiceer, doet of niet genetisch interageert, is het of is het niet resistent / gevoelig voor een bepaald medicijn, enz. .

Simba Gerelateerde software