Snelle statistische uitlijning voor Linux FSA is een probabilistisch meervoudig sequentie-uitlijningsalgoritme.
Download nu

Snelle statistische uitlijning voor Linux Rangschikking & Samenvatting

Snelle statistische uitlijning voor Linux Tags

Snelle statistische uitlijning voor Linux Beschrijving

Advertentie Snelle statistische uitlijning voor Linux is een thuis- en onderwijssoftware die is ontwikkeld door Robert Bradley. Na onze rechtszaak en test, wordt de software bewezen officieel, veilig en gratis te zijn. Hier is de officiële beschrijving voor snelle uitlijning van de statistische uitlijning voor Linux: FSA is een probabilistisch meervoudig sequentie-uitlijningsalgoritme dat een "op afstand gebaseerde" benadering gebruikt voor het afstemmen van homologe eiwit-, RNA- of DNA-sequenties. Veel als op afstand gebaseerde fylogenetische reconstructiemethoden zoals burenbredenheid bouwen een fylogenie met behulp van alleen paarswise divergence-schattingen, heeft FSA een meerdere uitlijning opgebouwd met behulp van alleen paarse schattingen van homologie. Dit wordt mogelijk gemaakt door de annealechniek van de sequentie voor het bouwen van een meervoudige uitlijning van paarsgewijze vergelijkingen. FSA brengt de hoge nauwkeurigheden die voorheen alleen beschikbaar zijn voor kleinschalige analyses van eiwitten of RNA's tot grootschalige problemen zoals het uitlijnen van duizenden sequenties of megabase-lange sequenties. FSA introduceert verschillende nieuwe methoden voor het construeren van betere uitlijningen: FSA maakt gebruik van machinebeleertechnieken om de GAP- en Substitutieparameters op de vlucht te schatten voor elke set invoersequenties. Deze "query-specifieke leren" uitlijnmethode maakt FSA erg robuust: het kan superieure uitlijningen van sets homologe sequenties produceren die onderhevig zijn aan zeer verschillende evolutionaire beperkingen. FSA is in staat om honderden of zelfs duizenden sequenties uit te lijnen met behulp van een gerandomiseerd inferentie-algoritme om de computationele kosten van meerdere uitlijning te verminderen. Deze gerandomiseerde inferentie kan meer dan tien keer sneller zijn dan een directe benadering met weinig nauwkeurigheid. FSA kan snel zeer lange sequenties uitlijnen met behulp van de techniek "Anchor ettering" voor het oplossen van ankers en het projecteren van ze met transitieve verankering. Het stikt vervolgens de uitlijning tussen de ankers met behulp van de hierboven beschreven werkwijzen. De meegeleverde GUI, MAD (display met meerdere uitlijning), kan de tussenliggende uitlijningen met FSA worden geproduceerd, waarbij elk teken wordt gekleurd volgens de waarschijnlijkheid dat het correct is uitgelijnd

Snelle statistische uitlijning voor Linux Gerelateerde software