Treecon Een tool die u zal helpen bij het maken van fylogenetische bomen
Download nu

Treecon Rangschikking & Samenvatting

Treecon Tags

volgorde Aminozuursequentie aminozuur fylogenetische boom

Treecon Beschrijving

Treecon is een softwarepakket dat voornamelijk is ontwikkeld voor de constructie en tekening van fylogenetische bomen op basis van evolutionaire afstanden die worden berekend uit nucleïsche en aminozuursequenties. In afstandswerkwijzen wordt de evolutionaire afstand berekend voor alle paren sequenties en wordt een fylogenetische boom afgeleid door de relatie tussen deze afstandswaarden te overwegen. Verschillende algoritmen zijn beschikbaar om een fylogenetische boom te construeren die beginnen met deze evolutionaire afstanden en een aantal van hen worden geïmplementeerd in Treecon. Bij het schatten van de evolutionaire afstanden tussen sequenties heeft het de voorkeur om te corrigeren voor gesuperponeerde mutaties en verschillende vergelijkingen hiervoor worden geïmplementeerd in het beschreven softwarepakket. Programma's voor het rooten van de ongrootte evolutionaire bomen, voor het tekenen van de boom op het scherm, en voor het opslaan van de boom zijn ook inbegrepen, evenals verschillende andere gereedschappen. Treecon is eenvoudig te gebruiken en voorafgaande kennis over computers is beperkt tot een absoluut minimum. Daarom moet het pakket bijzonder geschikt zijn voor moleculaire biologen en evolutionisten die evolutionaire bomen willen bouwen op basis van hun eigen moleculaire gegevens. Vanaf een eenvoudig ASCII-tekstbestand, dat nucleïne- of aminozuursequenties bevat met hiaten die nodig zijn voor wederzijdse uitlijning, kan men publiceerbare bomen op een gebruiksvriendelijke en eenvoudige manier produceren. Krijg Treecon en probeer het eens te zien hoe nuttig het kan zijn voor jou! Opmerking: Alleen gratis voor academisch gebruik.

Treecon Gerelateerde software