Treefinder berekent fylogenetische bomen van moleculaire sequenties
Download nu

Treefinder Rangschikking & Samenvatting

Treefinder Tags

moleculair Phylogenetische systematica volgorde berekent moleculair model fylogenetische boom display fylogenetische bomen fylogenetische bomen fylogenetische voetafdruk fylogenetisch Bekijk fylogenetische bomen Phylogenetische bomen Viewer manipuleren fylogenetische bomen trek fylogenetische bomen maken fylogenetische bomen fylogenetische bomengenerator analyseer fylogenetische bomen bewerk fylogenetische bomen Phylogenetische bomen-editor fylogenetische bomenanalyse Analyseer moleculaire sequenties Moleculaire sequentiesanalysator moleculaire sequentie Facebook chat-applicatie www.software.com Mobiele antivirussoftware Download Edit Photo www.iplookup.com Photoshop Converteer PDF mcafee antivirus editie i catcher schildwacht Nokia Asha 318 versleutelen exe bron Flash AMR-speler gratis downloa

Treefinder Beschrijving

De TreeFinder-applicatie berekent fylogenetische bomen van moleculaire sequenties. Het programma inktjes zelfs grote bomen door maximale waarschijnlijkheid onder verschillende modellen van sequentie-evolutie. Het accepteert zowel nucleotide- als aminozuurgegevens en neemt rekening met het beharogeniteit. Afzonderlijke modellen kunnen worden verondersteld voor door de gebruiker gedefinieerde data-partities, afzonderlijke tarieven, afzonderlijke randlengtes, afzonderlijke tekensamenstellingen. Alle parameters kunnen worden geschat op basis van de gegevens. Boom zoeken kan worden geleid door door de gebruiker geleverde topologische beperkingen en starten van bomen. Er is een model-indiener om passende modellen van sequentie-evolutie voor te stellen. Het vertrouwen van afgeleide bomen kan worden beoordeeld op parametrische en niet-parametrische bootstrapping, verschillende gepaarde sites-tests (ELW, BP, KH, SH, WSH, AU), ook in combinatie met informatiecriteria, randondersteuning van LR-ELW. Er zijn hulpmiddelen om bomen en sequentiegegevens te manipuleren, de basisfrequenties te visualiseren, consensus en afstandsbomen te berekenen, tellen topologieën. Vertrouwenlimieten en andere statistieken kunnen worden verkregen voor alle numerieke resultaten. Het programma kan divergentietijden schatten met simpling. Een grafische gebruikersinterface maakt het gebruik van TreeFinder zeer intuïtief. Gegevensbestanden en wederopbouwparameters kunnen interactief worden gekozen, resultaten worden op het scherm weergegeven. TreeFinder is programmeerbaar in de functionele en systeemonafhankelijke programmeertaal TL, die een breed scala aan functionaliteit biedt en de onderzoeker mogelijk maakt om probleemspecifieke toepassingen te maken. Delen van de software zijn in TL geschreven en kunnen door de gebruiker worden gewijzigd. TreeFinder's taal TL is een algemene programmeringstaal met tal van gespecialiseerde hulpmiddelen om biologische gegevens te verwerken. Het dient als een programmeerinterface van het TreeFinder-programma. Deze handleiding geeft een overzicht van TL. Wat maakt TL anders dan andere programmeertalen, is dat het een verscheidenheid aan programmeerstijlen ondersteunt. Op elk moment kan een programmeur de programmeerstijl kiezen die het krachtigst is in een bepaalde situatie.

Treefinder Gerelateerde software