Treefit Genetische gegevensanalyse eenvoudig gemaakt.
Download nu

Treefit Rangschikking & Samenvatting

Treefit Tags

analys analyse genetisch beeld Genetische gegevensanalysator Geneesmiddelen analyseren genetische data-analyse genetische gegevens genetisch Genetisch systeem Genetische gegevens sets analyse Analyseer genetische gegevenssets hercoderen genetische markeringsgegevens Genetische afstandsmatrix Genetische variatie-analyse genetische afstand analyse Genetische koppelingskaartenanalyse simuleer genetische kaart Genetische associatie-analyse genetische optimalisatie

Treefit Beschrijving

Evolutionaire bomen worden vaak gebruikt om genetische relaties tussen populaties te beschrijven. Hiërarchische, draaiende bomen zijn een redelijk model voor de evolutie van DNA-sequenties en soorten, maar kunnen al dan niet geschikt zijn voor het beschrijven van bevolkingsstructuur in populaties die zijn verbonden door genstroom. Als populaties bijvoorbeeld in een stappenpatroon zijn gerangschikt, volgen de genetische relaties tussen populaties niet een hiërarchisch patroon, en kunnen traditionele buren-toetredings- of Upgma-bomen geen passende hulpmiddelen zijn voor het beschrijven van de structuur van dergelijke populaties. TreeFit is een eenvoudige toepassing ontwikkeld om u te helpen analyseren hoe goed een boom past bij de genetische gegevens waarvan de boom is berekend. TreeFit creëert bomenbomen en Upgma-bomen van een genetische afstandsmatrix en vergelijkt vervolgens de waargenomen genetische afstand tussen populaties met de genetische afstand in de boom. De gelijkenis tussen deze afstanden is uitdrukkelijk als R-squared, de vertrouwde statistiek die wordt gebruikt om de scatter van punten rond te vatten rond de regressielijn van de kleinste vierkanten.

Treefit Gerelateerde software