Ugene Een complexe genoomanalyse suite
Download nu

Ugene Rangschikking & Samenvatting

Ugene Tags

analys complex Genome Browser Annotate genoom Gevisualiseer genoom Genome Zoek de genoomsequentie vinden genoomsequentie genoom analyseren Genoomanalyse Genome Analyzer Bekijk meervoudig genoom Meerdere genoomviewer zoekgenoom Genome Analyse Suite Meerdere sequentie uitlijning Hmm Virusgenoomvergelijking Vergelijk Virusgenoom Bekijk genoomsequentie Geef genoomsequentie weer Bekijk genome data Genome data-viewer blader door het genoom bekijk genoom Sluiten gerelateerd genoom genoomtaal prokaryotisch genoom Arabidopsis Genome Analyse Bekijk Arabidopsis-genoom analyseren Arabidopsis genoom analyseren bacteriële genoom Genoomvisualisatie Genoomviewer genoom-brede associatie Genome circulaire visualisatie complexe experimenten-analyse vergelijk genoomsequentie genoomsequentie UCSC-genoombrowsertrack Genoomnummer beheren genoom spoor manager analyseren van het menselijk genoom Genoomcalculator Bekijk het genoombestand genoommapping genoom kaartvisualisatie Genoom hybridisatie array Geef geno-gegevens weer Menselijke genoomanalyse menselijk genoom Bacteriële genoomsequentie Genoomverkenner Kwantitatief genoom microbieel genoom genoomvergelijking karakteriseren genoom genoom karakterisering Genoom positioneringssysteem rate genoom bekijken bacteriële genoom Visualisatie van bacteriële genoom

Ugene Beschrijving

Ugene is een uitgebreide genoomanalyse-suite met meerdere sequentie-uitlijning en een complexe HMM-bouwer en zoekmodule. Ugene is een handig hulpmiddel dat ook een visuele en interactieve genoom-surfenervaring biedt. Ook beschikbaar: draagbaar ugene Belangrijkste kenmerken: Meerdere sequentie-uitlijning met behulp van spier 3 en spier 4; HMM-profielen bouwen en zoeken, gebaseerd op de bron van HMMER 2 en HMMER 3; PCR-primers ontwerp met primer 3; eiwit secundaire structuurvoorspelling met GOR IV en PSIPRED; Zoek naar restrictie-enzymen en integratie met rebase; extreem snel herhaaldzoeker; Zoeken naar transcriptiefactor bindingsplaatsen met behulp van Sitecon; ORF FINDER; complete implementatie van de Smith-Waterman-algoritme. chromatogrammen visualisatie; 3D-viewer voor bestanden in PDB- en MMDB-indelingen; Meerdere sequentie-uitlijningseditor; Eenvoudig te gebruiken Workflow Designer voor aangepaste computationele workflows. volledige ondersteuning van moderne multicore-processors en SSE-instructies; uit de doossteun van moderne GPU's met behulp van Nvidia Cuda en ATI-stream; geïntegreerde oplossingen voor celbreedbandmotor; Private Solutions voor supercomputers en gedistribueerde computeringen.

Ugene Gerelateerde software