Virale genoomorganisator Genome browser om via Java te gebruiken
Download nu

Virale genoomorganisator Rangschikking & Samenvatting

Virale genoomorganisator Tags

Browser browsen Java-browser Genome Browser Genome blader door het genoom

Virale genoomorganisator Beschrijving

Virale Genome Organizer of VGO gemaakt om een eenvoudig te gebruiken Java-gebaseerde genoombrowser te zijn. Het kan worden gebruikt om informatie over een genoom weer te geven, inclusief de genen, ORF's en Start / Stop Codons. Het kan ook worden gebruikt om een reguliere expressiebezoek, een fuzzy motiefzoekopdracht uit te voeren en een zoekopdracht in massa's. Omdat VGO's met onze database van genoomsequenties (VOC's) kunnen worden gebruikt om genomomen te vergelijken. Belangrijkste kenmerken: Bekijk genen en voorspelde ORF's in een of een reeks van genomes. Weergave Start- en stopcodons binnen de sequentie Zoek naar sequenties binnen Genomes met behulp van reguliere uitdrukkingen; E.G GGATCC of TTTTTT T met behulp van een fuzzy-zoekpatroon; b.v. GGATCC waardoor één mismatch voor genen met de hoogste bij compositie Gebruik een GUI om regio's van een genoom te selecteren en uit te halen Display orthologs in een reeks genomen door de GUI te gebruiken om een gen in een ander genoom te selecteren geeft een perceel van nucleotidesamenstelling weer. Zoek naar het langste oligonucleotide dat wordt gedeeld tussen een reeks niet-gealigneerde genomomen Zoek het vertaalde genoom voor wedstrijden aan massaspecificatiepeptiden Grafisch gegevens weergeven van andere programma's bovenop het genoomdisplay

Virale genoomorganisator Gerelateerde software