Zeezicht Deze applicatie is in staat om verschillende uitlijningsindelingen te lezen en te schrijven.
Download nu

Zeezicht Rangschikking & Samenvatting

Zeezicht Tags

Lezen volgorde tekstuitlijning Lees uitlijningsindelingen grafische uitlijning-editor Schrijf uitlijningsindelingen uitlijning Schrijftoepassing creëer uitlijning Documentuitlijning uitlijning van visualisatie Manipulate uitlijning uitlijningsmanipulatie nauwkeurigheid van de uitlijning Eiwituitlijning multiple alignment alignment-editor alignment Method weergave uitlijning gesplitste uitlijning paarsgewijze uitlijning-analyse analyseer paarsgewijze uitlijning view uitlijning bestand uitlijningsbestand weergeven analyse van uitlijning pagina uitlijning

Zeezicht Beschrijving

Seafiew is een softwaretoepassing die specifiek is ontworpen om u te helpen bij het bestuderen en analyseren van sequentie-uitlijningen, evenals moleculaire fylogenie. Het integreert vaardigheden voor het lezen en schrijven van verschillende bestandsindelingen, zoals Nexus, AZG, Clustal, Fasta, Phylip, Mase en Newick-bestanden. Draagbare packagethis is een stand-alone programma dat direct op uw computer kan worden uitgevoerd zonder te worden geïnstalleerd op een manier die uw Windows-registerconfiguratiegegevens wijzigt. U kunt het hulpprogramma opslaan op opslagapparaten zoals USB-flashstations. Het beste deel Wanneer u draagbare gereedschappen gebruikt, is dat u geen beheerdersrechten nodig hebt om de programma's uit te voeren terwijl ze geen bestanden of instellingen op de hostcomputer verlaten. GebruikersinterfaceOnderig De GUI maakt niet meer indruk op veel in de visuele afdeling, het is eigenlijk praktisch en gemakkelijk mee te werken. Drag-and-drop-ondersteuning staat ook in de lijst met functies, zodat u snel gegevens van een extern bestand kunt importeren. U kunt gebruikmaken van toetsenbordsnelkoppelingen voor het verkennen van gegevens of druk op muisklikken voor het selecteren van items en het verplaatsen van geselecteerde sequenties naar een andere plaats in een uitlijning. Het gereedschap kan ook worden uitgevoerd met behulp van de opdrachtregel. Het importeren / exporteren van optiesaside van de ondersteunde bestandsindelingen die in de inleiding zijn opgesomd, u kunt informatie toevoegen uit verschillende databases, zoals EMBL, Genbank en SwissProt / Uniprot. Bovendien kunt u de uitlijning in het huidige bestand of het exporteren van gegevens naar een bestand opslaan, de uitlijning opslaan op PDF-bestandsindeling (u krijgt de vrijheid om het lettertype, blok en papierformaat te wijzigen, de kleur te wijzigen en alleen variabele sites te wijzigen van de uitlijning en hun posities). U mag een uitlijning toevoegen aan het einde van een ander op naam of rang. Bewerkingsfuncties en uitlijning-optiesEAView geeft u de mogelijkheid om de geselecteerde reeksen naar het klembord te kopiëren, de uitlijningsgegevens van het klembord te plakken, alle sequenties uit de uitlijning te selecteren, de momenteel geselecteerde reeks te hernoemen, opmerkingen bewerken en een reeks bewerken door een reeks te wijzigen gegevens of openen van twee bewerkingsvolgordepanelen en het overbrengen van informatie tussen hen. Andere handige taken die kunnen worden toegepast op sequenties, verwijzen naar het verwijderen, maken en laden van ze. Bovendien kunt u ze dupliceren en omkeren, een DOT-plot-analyse uitvoeren, alle GAP-sites uit de uitlijning verwijderen en de genetische code instellen voor het vertalen naar eiwit de geselecteerde sequentie (en). Als het gaat om acties die u helpen bij het beheren van uitlijningen, kunt u de doeluitlijning uitvoeren op alle of geselecteerde reeksen, geselecteerde sites of een profiel (meer specifiek een groep vooraf uitgelijnde sequenties). Met de configuratie-instellingen en andere krachtige ToolseSEVIEW Hiermee kunt u de lettergrootte instellen die wordt gebruikt om sequenties weer te geven, DNA-sequenties weer te geven, als eiwitbedieningen, gebruik de kleurregels voor het definiëren van de eiwitsequenties, het genereren van statistieken over base- of aminozuursequentiesamenstellingen, overgangs- en transversie-tellingen, specificeren het Delen van een meerdere uitlijning die moet worden opgeslagen voor verdere analyse, maken en slaan soorten instellen in als de MASE- of NEXUS-indeling wordt gebruikt, voeg de reactieslijnen aan de onderkant van het scherm in en voer zoekopdrachten uit. Bovendien kunt u DNA of eiwitfylogenetische bomen, uitzetten, tekenen, importeren en opslaan, opslaan, afdrukken en fylogenetische bomen opslaan en een analyse van een 'puntplot' van twee sequenties uitvoeren. Bottom line Al met al blijkt Seaview een geavanceerd programma te zijn voor meerdere sequentie-uitlijning en moleculaire fylogenie, en is geschikt voor speciaal voor krachtgebruikers. Beoordeeld door Ana Marculescu, laatst bijgewerkt op 26 september 2014

Zeezicht Gerelateerde software