jmotu BARCODE DNA SEQUENTIE Gegevensanalyse Gemakkelijk gemaakt.
Download nu

jmotu Rangschikking & Samenvatting

jmotu Tags

analyse Analyseren Lezen DNA-sequentie DNA-analyse Converteer DNA-sequentie Stretching DNA-analyse Lees DNA-sequentie DNA-sequentielezer Analyse DNA-sequentie DNA-sequentie bewerken DNA Sequence Editor Bekijk DNA-sequentie DNA-sequentie-analyse Bekijk DNA-gegevens DNA-gegevens weergeven DNA-gegevens Volgorde uitlijningsgegevens gegevenssequentie DNA sequentie analyse Lijn de DNA-sequentie uit Vergelijk DNA-sequentie DNA-gegevensset-analyse DNA Fingerprint Data DNA-sequentie manipulatie uitgelijnde DNA sequentiegegevens Genomische DNA-sequentie Sequence Data Viewer Converteer DNA-gegevens Gegevensvolgorde visualisatie DNA-sequentie comprimeren DNA-sequentiecompressie codeer DNA-sequentie DNA Sequence Compressor Database-sequentie-analyse DNA-sequentiegegevens Lees invoersequenties Zoek volggegevens Sequentiegegevensonderzoeker Sequence Data Analyse analyseer DNA-sequentiegegevens DNA-sequentiegegevensanalyse Analyse DNA-sequentie Bekijk DNA-methyleringsgegevens Bekijk sequentiegegevens analyseer sequentiegegevens Sequence Data Analyzer Sequence-bestandsanalyse analyseren sequentiegegevens sequentiegegevens DNA-methyleringsanalyse DNA-sequentievisualisatie sequentiegegevenscontrole Meerdere sequentie-analyse DNA Sequence Evolution DNA-restrictieanalyse

jmotu Beschrijving

Jmotu is handig, eenvoudig te gebruiken pakket dat speciaal is ontworpen om u te helpen bij het cluster van streepjescode-DNA-sequentiegegevens in moleculaire operationele taxonomische eenheden (MOTU). Als u niet zeker weet wat een motu is, raadpleegt u de DNA-barcoderingspagina's op onze website. JMOTU doet het volgende: · Leest invoersequenties in FASTA- of NEXUS-formaat · Berekent de afstanden tussen paren sequenties met behulp van een combinatie van explosie en de NEEFLAND-LOWER-SLEUTELIJKE ALNGORITMERHM · Clusters invoeren sequenties in motu met behulp van verschillende cutoff-maatregelen Jmotu kan grote gegevenssets verwerken en gebruikt een reeks filterstappen om het aantal exacte wereldwijde uitlijningen te minimaliseren dat moet worden uitgevoerd. Bij het berekenen van de paarsgewijze afstanden, negeert JMOTU lacunes en telt alleen nucleotide mis-matches, waardoor het relatief robuust is voor sequentiebepaling die worden veroorzaakt door homopolymeerruns. Clustering wordt uitgevoerd met behulp van een hebberig algoritme dat niet afhankelijk is van de volgorde van invoersequentie. JMOTU is getest op onbewerkte datasets van ongeveer 50.000 invoersequenties en kan grotere datasets clusteren door het voorkomen van subsets van gegevens voordat ze worden gecombineerd voor een wereldwijde analyse.

jmotu Gerelateerde software