pppbenchmark

Een grootschalige benchmarkingstudie van 17 state-of-the-art promotorvoorspelprogramma's
Download nu

pppbenchmark Rangschikking & Samenvatting

Advertentie

  • Rating:
  • Vergunning:
  • GPL
  • Prijs:
  • Free
  • Naam uitgever:
  • By Thomas Abeel
  • Besturingssystemen:
  • Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP
  • Aanvullende vereisten:
  • Java 1.6 or later
  • Bestandsgrootte:
  • 5.6 MB
  • Totaal aantal downloads:
  • 39

pppbenchmark Tags


pppbenchmark Beschrijving

Een meervoudige evaluatiestrategie wordt voorgesteld die kan worden gebruikt als een gouden standaard voor promotorvoorspelling-evaluatie, waardoor auteurs van Promotor Voorspellingssoftware hun methode op de juiste manier kunnen vergelijken. Deze evaluatiestrategie wordt vervolgens gebruikt om de gekozen promotor voorspellers te vergelijken, en een diepgaande analyse op voorspellende prestaties, promotorklassespecificiteit, overlapping tussen voorspellers en positionele voorspanning van de voorspellingen wordt uitgevoerd. Wanneer u dit programma gebruikt om nieuw ontwikkelde programma's te valideren, is het belangrijk dat u de gegevens die wordt gebruikt voor validatie in PPPBenchmark niet gebruiken als trainingsgegevens voor uw programma. De juiste procedure hier zou zijn om de gegevens in opleiding en testen te splitsen en uw programma en PPPBenchmark uit te voeren voor elke splitsing. De beste manier om de gegevens te splitsen, is op het niveau van complete chromosomen. Gebruik bijvoorbeeld 23 chromosomen voor training en degene die is weggelaten voor validatie. Doe dit voor elk chromosoom weggelaten. Krijg PPPBenchmark en probeer het eens te zien hoe nuttig het kan zijn voor jou!


pppbenchmark Gerelateerde software

ZT

Een software voor eenvoudige en gedeeltelijke schoorsteentests ...

210 337 KB

Downloaden

Gemberbier

Een tool die meta-analyses uitvoert via de Activation Likelihood-schatting (ALE) -methode ...

103 2.1 MB

Downloaden