Bioimagexd Dit is een gratis, open source-software voor analyse en visualisatie van multidimensionale biomedische afbeeldingen
Download nu

Bioimagexd Rangschikking & Samenvatting

Bioimagexd Tags

Analyseren kijker visie Multidimensionale gegevensviewer multidimensionaal Bekijk biomedisch beeld Analyse biomedisch beeld Biomedical Image Viewer Visualisatie-software Visualization-gegevensbron het ontwikkelen van visualisatiesoftware Multidimensionale gegevensverkenner Multidimensionale gegevens software-visualisatie Proces biomedisch signaal MRI-beelden visualisatie MRI-afbeeldingenanalyse Biomedisch

Bioimagexd Beschrijving

Bioimagexd is een softwarepakket voor verwerking, analyseren en visualiseren van multidimensionale beeldgegevens. Zoals de naam inhoudt, is de software primair bedoeld voor biologische gegevens, bijvoorbeeld confocale microscopiebeelden van levende cellen, maar het is volledig geschikt voor het werken met elke vorm van multidimensionale beeldgegevens. Bioimagexd heeft een eenvoudige, intuïtieve gebruikersinterface op basis van een enkel groot raam en zijn operaties zijn ontworpen om consistent en functioneel te zijn. BioimagexD biedt geavanceerde bestandsinvoer / uitgangsfuncties en meerdere visualisatiemodi (variërend van eenvoudige 2D-slice-weergave naar geavanceerde 3D-rendering). Deze kunnen vrij worden gecombineerd met een van de talrijke taakmodi (inclusief kanaalscusatie, colocalisatie-analyse, intensiteitscorrectie en verschillende filters voor het verwijderen van ruis, segmentatie, tracking, metingen enz.). Met het ingebouwde Animater kunt u verbluffende covens maken, omdat het volledige controle heeft op de wijzigingen in de cameratijdspad en het bekijken van hoeken. Belangrijkste kenmerken: Beeld bekijken: Open gegevens in gemeenschappelijke microscopische indelingen (of afbeeldingen of stapels afbeeldingen en tijdreeksen) en bekijk de gegevens afbeelding op de afbeelding. Beeldverwerking: Pas Kleur / Helderheid / Contrast / Gamma aan, wijzig kleur of palet van een dataset / kanaal, filter ruis, correct voor fluorescentiebewijzing in de gegevens van de tijdseries. 3D-volume weergave: 3D-datasets kunnen interactief volume worden weergegeven Film maken: Gebruik de animatormodule om een camera-pad rond uw 3D-gegevens in te stellen en een film te maken van het draaien en vliegen hoewel zoomen op welke manier u maar wilt. Time-serie-gegevens worden ondersteund: "4D-gegevens". Colocalisation Analyse: We kennen alle celbiologen die confocale microscopie gebruiken, zijn altijd op zoek naar colocalisatie! Onze Colocalisation-tool biedt u de mogelijkheid om de colocalisatie van de signaalintensiteit te analyseren in een multi-kanaals 3D-gegevensset, het probleem van valse colocalisatie te vermijden die wordt gezien in afbeeldingen van z-stack-projecties en voert u een aantal statistische analyses uit die u harde nummers geven over het bedrag en de kwaliteit van colocalisatie in uw gegevens. Gebruikt soortgelijke algoritmen aan die in Imagej, bijvoorbeeld de WCIF-plug-in voor automatische colocalisatiedrempels, met behulp van de methode van Costes et al. AFM Beeldweergave: Atomic Force Microscopie en gerelateerde beeldvormingstechnieken maken afbeeldingen die kunnen worden weergegeven als 3D-oppervlakken. We kunnen ook enkele nuttige beeldfilters en dergelijke toevoegen. Misschien een soort AFM-vorm - PDB of Cryoem Structure / Model Fitting Tool. COMAPRISIS VAN CEL OPERICHTE HOOGTE Beelden met confocale 3D-datasets. multiprocessor, parallelle computing, clusters en supercomputers: Als onderdeel van het FINHPC-project zijn we van plan om bioimagexd in te schakelen om beeldverwerking en andere functies parallel en met CPU-specifieke vectorisedcode (ALTIVEC / Snelheidsmotor op G4 en G5, en MMX SSE SSE2 SSE3 op desktop op het bureaublad in te voeren Computers, clusters, werkstations, servers en supercomputers met groot gedeelde geheugen

Bioimagexd Gerelateerde software