Hapedit HAPLOTYPE MONTAGE VIEWER GEBASEERD IN JAVA
Download nu

Hapedit Rangschikking & Samenvatting

Hapedit Tags

php adder html HTML-editor PHP-editor bijeenkomst asp-editor onderzoek DNA-sequentie HTML-bewerking haplotype

Hapedit Beschrijving

Hapedit is een instrument dat speciaal is gebouwd om de gebruiker te helpen de nauwkeurigheid van Haplotype-assemblage te beoordelen. Dit gebeurt met behulp van de volgende generatie sequencing-technologieën. Hapedit is een tool die is gemaakt met behulp van de Java-programmeertaal en kan op meerdere platforms worden uitgevoerd. Belangrijkste kenmerken: in plaats van een haploïde consensussequentie, worden haplotype-segmenten weergegeven bovenaan het venster Haplotype-assemblage. Een kwaliteitsscore die de nauwkeurigheid beoordeelt voor geassembleerde HAPLOTYPE-segmenten wordt weergegeven onder de HAPLOTYPE-segmenten. Een gelezennaam is gekleurd, als gevolg van de sequencing-technologie die wordt gebruikt voor de lees. -toepassingen zijn differentieel gekleurd volgens hun kwaliteitscores. Dit vergemakkelijkt een gebruiker om base-oproepen van lage kwaliteit te vinden. Door te dubbelklikken op een specifieke regio in het venster Montage Navigatie, kan een gebruiker het gedetailleerde weergave bekijken dat wordt weergegeven in het venster Haplotype-assemblage. Misassembleer Haplotype-segmenten kunnen in stukken worden gebroken. De verbinding van HAPLOTYPE-segmenten die wordt bevestigd door aanvullende gegevens is ingeschakeld door eenvoudige muisactiviteiten. De samenstellingspercentages van sequencing-technologieën worden geanalyseerd en weergegeven in staafdiagrammen. Evenzo zijn de sequentie en de kloondekking ook samengevat in cirkeldiagrammen.

Hapedit Gerelateerde software