Imas Bekijk en analyseer genomische informatie met behulp van deze applicatie.
Download nu

Imas Rangschikking & Samenvatting

Imas Tags

analys analyse weergave Analyseer informatie Genomische regio methylatie genomische methylatie Bekijk genomische informatie Analyseer genomische informatie genomische informatie viewer Bekijk genomische gegevens genomische data viewer Ontdek genomische gegevens genomische sequentie van zoogdieren genomische simulator genomische simulatie genomisch toegang tot genomische diversiteit genomische datasimulatie genomische gegevens analyseren genome structuurvariatie Genomische loci Genomic Annotator

Imas Beschrijving

Imas of het interactieve multigenomische analysesysteem is een nieuw visueel analyse-systeem dat speciaal is ontworpen voor de ontdekking van kennis in genomische informatie. IMAS stelt genomische wetenschappers in staat om snel een reeks microbiële genomische sequenties te analyseren met behulp van hulpmiddelen zoals glans, blast, clustalw, primer3 en transport en om de uitvoer van deze hulpmiddelen in een verenigd genomisch kader te visualiseren. IMAS biedt de gebruiker een 1-dimensionale zoomen grafische interface op een genomische sequentie. De gebruiker kan communiceren met de sequentie om te analyseren op de aanwezigheid van coderende regio's, die verder kunnen worden geanalyseerd door sequentie-uitlijning met lokale en externe databases met behulp van BLAST. Blast-resultaten worden weergegeven in een uniform grafisch raamwerk waarmee de gebruiker kan filteren en om externe hits van belang te selecteren. Geselecteerde Blast-hits kunnen dan multiificed worden gebruikt met behulp van Clustalw en deze multi-flinkt worden weergegeven met behulp van het gemeenschappelijk grafisch kader. Multiignments en paarsgewijze afstemming kunnen worden geannoteerd door de gebruiker voor toekomstige referentie- en HTML-rapporten kunnen worden gegenereerd met deze bevindingen. Belangrijkste kenmerken: Zoombare gebruikersinterface - snel! Draait analyseprogramma's lokaal (explosie, glans, clustal ...) IMAS Blast kan NCBI NR-database zoeken Draait Hmmpfam op lokale kopie van PFAM-gegevens kan BLAST DBS maken van INSDSEQ XML-bestanden

Imas Gerelateerde software