Peaks Studio Een complete proteomics-software die wordt gebruikt voor het verkrijgen van nauwkeurige en gevoelige peptide-identificatie-resultaten
Download nu

Peaks Studio Rangschikking & Samenvatting

Peaks Studio Tags

peptide organisme spectrometrie massaspectrometrie

Peaks Studio Beschrijving

Peaks Studio is een gebruiksvriendelijke toepassing die speciaal is ontworpen voor onderzoekers. Het stelt hen in staat om nauwkeurige resultaten te verkrijgen bij het bestuderen van de volgende organismen. Vrijwel, het is een proteomische massaspectrometrie-software die een de Novo-sequentiemethode gebruikt. Gebruikers kunnen vervolgens het geïntegreerde PTM-identificatietool gebruiken om PTM's te identificeren, of de spinetool om eventuele peptide-mutaties te identificeren. In plaats van uitsluitend te zoeken in een eiwitsequentiedatabase, integreren pieken vier verschillende algoritmen om database-peptiden, nieuwe peptiden, PTMS en gemuteerde peptiden uit de gegevens te identificeren. Al deze analyses worden gedaan in een geautomatiseerde workflow en vereisen geen gebruikersinterventie. Alle geïdentificeerde peptiden (samen met mutaties en PTM's) zijn uitgelijnd in een proteïne-dekkingsvenster dat de dekking en eventuele mutaties en PTM's voor elk afzonderlijk aminozuur van het eiwit benadrukt. Uitgaande van de onbewerkte massaspectrometrie-gegevens tot de eindresultaatvalidatie, visualisatie en rapportage, pieken maakten het hele proces eenvoudig en eenvoudig. De standaardanalyse workflow en ingebouwde resultaatvalidatie laten zelfs een beginner toe om de gegevens eenvoudig te analyseren en resultaten van hoge kwaliteit te produceren. Ondertussen maakt de zorgvuldig ontworpen visualisatie-interface de geavanceerde gebruikers om spontaan elke identificatie van het algoritme te onderzoeken, aan het detail van individuele pieken die de karakterisering van elk enkel aminozuur ondersteunen. Ten slotte kan het resultaat eenvoudig worden geëxporteerd naar HTML en verschillende tekstindelingen voor publicatie, resultaatverdeling en nabewerking. Opmerking: Om een proefsleutel te verwerven, zijn gebruikers nodig om toegang te krijgen tot deze link. Belangrijkste kenmerken: de Novo-sequencing: sequentie peptiden zonder een database en identificeren potentieel nieuwe peptiden die niet in een database zijn PEPS DB: Nauwkeurige en gevoelige peptide-identificatie en eiwitsequenties met ingebouwde FDR-resultatenvalidatie. Inchorus: Benchmark Verschillende motoren en valideer uw resultaten Peaks PTM: Schakel de ingebouwde PTM's handmatig aan of gebruikers kunnen een blinde PTM-zoekopdracht doen die alle 650+ PTMS in zich brengt. Spider: Sequence Tag Homology Zoeken om mogelijke mutaties in de resultaten te identificeren PEPS Q: Voer een nauwkeurige eiwitkwantificatie uit

Peaks Studio Gerelateerde software