Bio :: Nexus :: UnalignedBlock BIO :: NEXUS :: UnalignedBlock is een PERL-module die een niet-gealigneerd blok van een Nexus-bestand vertegenwoordigt.
Download nu

Bio :: Nexus :: UnalignedBlock Rangschikking & Samenvatting

Bio :: Nexus :: UnalignedBlock Tags

blok Perl-module Nexus-bestand Niet-gealigneerd blok Niet uitgelijnd

Bio :: Nexus :: UnalignedBlock Beschrijving

BIO :: NEXUS :: UnalignedBlock is een PERL-module die een niet-gealigneerd blok van een Nexus-bestand vertegenwoordigt. BIO :: NEXUS :: UnalignedBlock is een PERL-module die een niet-gealigneerd blok van een Nexus-bestand vertegenwoordigt.synopsis if ($ Type = ~ / niet-gealigneerd / i) {$ Block_Object = NIEUW BIO :: NEXUS :: UnalignedBlock ($ Type, $ blok, $ uitgebreid); } Dit is een klasse die een niet-gealigneerd blok vertegenwoordigt in Nexus FileMethodsNew Titel: Nieuw Gebruik: Block_Object = Nieuwe Bio :: Nexus :: UnalignedBlock ($ Block_Type, $ commando's, $ uitgebreide, $ taxLabels); Functie: Creëert een nieuwe BIO :: NEXUS :: UnalignedBlock Object Retouren: BIO :: NEXUS :: UnalignedBlock Object Args: Type (string), De opdrachten / opmerkingen om te ontleden (Array Ref) en een uitgebreide vlag (0 of 1) Find_Taxon Titel: Find_taxon Gebruik: My $ IS_TAXON_Present = $ Self-> Find_Taxon ($ TAXON_NAME); Functie: vindt of de naam van het ingangsbelasting aanwezig is in het taxonlabel. Retourneren: 0 (niet aanwezig) of 1 (indien aanwezig). Args: Taxon Label (als String) SET_FORMAT TITEL: SET_FORMAT GEBRUIK: $ BLOCK-> SET_FORMAT (% -indeling); Functie: Stel het formaat van de personages in: None Args: Hash of FormationSGet_Format Titel: Get_Format Gebruik: $ Block-> Get_Format (); Functie: Retourneert het formaat van de Karakters Retouren: Hash of Format-waarden Args: Noneset_OTUSET TITEL: SET_OTUSET GEBRUIKER: $ BLOK-> SET_OTUSET ($ OTUSET); Functie: Stel de OTUS-returns in: Geen Args: TaxunitSet Objectset_CharStatelabels Titel: Set_CharStatelabels Gebruik: $ Block-> Set_Charstatelabels ($ Labels); Functie: Stel de tekennamen en staten terug: None Args: array of Character Statesget_CharStatelabels Titel: Get_CharStatelabels Gebruik: $ Set-> Get_CharStatelabels (); Functie: Retourneert een reeks karakterstaten Retouren: Karakterstaten Args: NONEGET_NTAX TITEL: GET_NTAX GEBRUIK: $ BLOK-> GET_NTAX (); Functie: Retourneert het aantal taxa van het blok Retouren: # TAXA AGS: NONDENAME_OTUS TITEL: RENAME_OTUS GEBRUIK: $ BLOK-> RENAME_OTUS (% vertaling); Functie: Hernoemt alle OTUS aan iets anders retourneert: Geen Args: Hash bevat de naam van de vertaling van de naam: gelijk aan het gebruik: $ block-> gelijken ($ een ander); Functie: Vergelijk of twee bio :: Nexus :: UnalignedBlock-objecten zijn gelijke rendementen: Boolean Args: A Bio :: Nexus :: CharacterBlock Object Vereisten: · Perl

Bio :: Nexus :: UnalignedBlock Gerelateerde software