Bio :: POPGEN :: HTSNP BIO :: POPGEN :: HTSNP.PM-module kan HTSNP selecteren uit een HAPLOTYPE-set.
Download nu

Bio :: POPGEN :: HTSNP Rangschikking & Samenvatting

Bio :: POPGEN :: HTSNP Tags

Perl-module bioperl Bio Perl selecteer htSNP Popgen HtSNP

Bio :: POPGEN :: HTSNP Beschrijving

BIO :: POPGEN :: HTSNP.PM-module kan HTSNP selecteren van een HAPLOTYPE-set. Bio :: POPGEN :: HTSNP.PM-module kan HTSNP selecteren van een HAPLOTYPE SET.SYNOPSIS GEBRUIK BIO :: POPGEN :: HTSNP; Mijn $ Obj = BIO :: POPGEN :: HTSNP-> NIEUW ($ HAP, $ SNP, $ POP); Selecteer de minimale set SNP die de volledige informatie over het haplotype bevat zonder ontslagen. het haplotype-blok (array van array). - De SNP-ID (array). - Gezinsinformatie en -frequentie (array van array). Het laatste haplotype wordt gegenereerd in een numeriek formaat en de SNP's sets kunnen worden opgehaald van de module.consideringen: - Als u dwingt om een gezin met onbepaalde tijd op te nemen, wordt de SNP's met onbepaalde tijd verwijderd uit de analyse, dus overweeg dan voordat u uw Gegevensinstelling Wat wilt u echt doen .- Als twee gezinnen dezelfde informatie hebben (identiek haplotype), wordt een van hen verwijderd en worden de verwijderde bestanden opgeslagen Classify zoals verwijderd. - Alleen worden geaccepteerd voor berekening A, C, G, t en - (als deletion) en hun combinaties. Elke andere waarde als n of? wordt beschouwd als degeneraties als gevolg van gebrek aan informatie. Vereisten: · Perl

Bio :: POPGEN :: HTSNP Gerelateerde software