Bloesok BLOSSOC is een koppelingsverzamelingsvereniging die toewijzingstool die probeert (perfecte) genealogieën te bouwen.
Download nu

Bloesok Rangschikking & Samenvatting

Bloesok Tags

vereniging onevenwichtigheid Mapping tool onevenkige associatie bouwen genealogieën Blossoc is een koppeling

Bloesok Beschrijving

BLOSSOC is een koppelingsverwijzingsverzamelingstool die probeert (perfecte) genealogieën te bouwen. BLOSSOC is een koppelingsverzamelingsvereniging toewijzingstool die probeert (perfecte) genealogieën voor elke site in de input te bouwen, scoren deze volgens niet-willekeurige clustering van getroffen personen, en rechter hoog scorende gebieden als waarschijnlijk de lokale genealogische bomen, de lokale genealogiebomen Op een aantal heuristieken die niet gegarandeerd ware bomen bouwen, maar het voordeel hebben over meer geavanceerde methoden om extreem snel te zijn. Blossoc kan daarom veel grotere datasets met meer geavanceerde gereedschappen aankunnen, maar tegen de kosten van het offeren van een nauwkeurigheid. Installatie: Blossoc is geschreven in C ++ en is verkrijgbaar als broncode (onder de GNU-generaal Public License, GPL) en als binaire versies Linux RPM-bestanden. De broncode is met succes gecompileerd op verschillende Linux- en UNIX-systemen. Omdat ik slechts beperkte toegang heb tot andere architecturen dan Linux, is het niet mogelijk om binaire uitkeringen voor andere platforms te maken, maar als iemand bereid is om de distributies te bouwen, zal ik ze meer dan blij zijn om ze op deze site te plaatsen. Gebruik: Blossoc wordt gestart vanaf de opdrachtregel en neemt, zoals input, een bestand met de posities van markers en een bestand met HAPLOTYPE-gegevens. Het formaat van het HAPLOTYPE-bestand is: één regel per haplotype, waarbij een haplotype wordt weergegeven als een Lijst met ruimte-gescheiden allelen, en elk allel vertegenwoordigd als een '0' of een '1'.De eerste kolom is een' pseudo'-allel die wordt gebruikt voor de Case / Control Dichotomy: A '0' in de eerste kolom is genomen om te betekenen dat het haplotype een besturingshaplotype is en een '1' bij de eerste kolom wordt genomen om te betekenen dat het haplotype een geval is haplotype. Voer BLOSSOC -HELP uit om een volledige lijst met opdrachtregelopties te krijgen die door BLOSSOC worden geaccepteerd door BLOSSOC.WAT IS NIEUW IN DEZE RELEASE: · Deze versie is een poort naar de nieuwe SnPFile Format-versie 2.0.

Bloesok Gerelateerde software