Cel-elektrofysiologische simulatieomgeving Cell-elektrofysiologische simulatieomgeving is een simulatieomgeving voor elektrofysiologie.
Download nu

Cel-elektrofysiologische simulatieomgeving Rangschikking & Samenvatting

Cel-elektrofysiologische simulatieomgeving Tags

simulatie omgeving simulatieomgeving elektrofysiologische simulatie elektrofysiologie

Cel-elektrofysiologische simulatieomgeving Beschrijving

Cel-elektrofysiologische simulatieomgeving is een simulatieomgeving voor elektrofysiologie. Cel-elektrofysiologische simulatieomgeving (CESE) is een alomvattend kader dat specifiek is ontworpen om computationele elektrofysiologische simulaties uit te voeren, bijvoorbeeld, simulaties van cardiale myocyte elektrische activiteit.Cell-elektrofysiologische simulatieomgeving is handig voor simulaties van actiepotentialen, individuele ionische stromingen en veranderingen in ionische concentraties en veranderingen in ionische concentraties .Cese is een cross-platformprogramma, het draait op elk systeem met Java Runtime Environment (JRE) versie 1.4 of hoger. Het is getest op Windows, Linux, Solaris, MacOS X en Aix.Cese GebruikersCese is een geïntegreerde omgeving voor het uitvoeren van computationele simulaties met behulp van een verscheidenheid aan elektrofysiologische modellen.at deze fase CESE maakt het maken van creatie en uitvoering van de single-cell-modellen. HODGKIN-HUXLEY (HH) en Markovian-actuele formuleringen). Modellen van elektrische activiteit van cardiale myocyten met broncode zijn opgenomen in de distributie van CESE. We hopen het aantal beschikbare modellen uit te breiden en bepaalde neuronale modellen in de toekomst toe te voegen. De hoofdsterkte van CESE bevindt zich in de uniformiteit van de uniformen Een programma-interface blijft hetzelfde voor verschillende soorten modellen. U kunt eenvoudig schakelen tussen modellen en simulatie-uitgangen vergelijken. Modelparameters kunnen worden gewijzigd, geselecteerd voor uitvoer en / of geklemd in dezelfde, standaard Way.Cese verlengt de conventionele elektrofysiologische betekenis van de "Voltage-klem". U kunt vrijwel elke modelvariabele klemmen, inclusief spanning (membraanpotentiaal), totale of individuele ionische stromingen, ionische concentraties, temperatuur, poortenvariabelen, enz. De klemopdrachten kunnen complexe stukvormige functies zijn, individueel ingesteld voor de interesse van het model . Dit opent eindeloze mogelijkheden voor de verkenning van complex modelgedrag.Cees biedt eenvoudige, maar efficiënte gegevensvisualisaties. Simulatieresultaten kunnen worden gepresenteerd in de grafische en tabelvormen. Percelen kunnen worden aangepast en gebieden van interesse Zoomd.even Hoewel CESE niet is ontworpen om een tool voor gegevensanalyse te zijn, kunt u huidige spanningsrelaties (I-VS) genereren en statistische parameters in het programma binnen het programma berekenen. U kunt uw gegevens exporteren naar ASCII, Axon Text File (ATF) en NetCDF-formaten om door te gaan met de analyse in uw favoriete pakket.Cees DeveloperCese is gemaakt van de grond om de beste programmeringspraktijken die beschikbaar zijn voor Java-ontwikkelaars, zowel qua gebruiker in termen van gebruiker op te nemen. interface consistentie en codehelderheid en hergebruik. Indien mogelijk is CESE op beschikbare Java API's (bijvoorbeeld Java2D, Javabeans, JAXP) om de Code.model-creatie te vereenvoudigen vereist een aantal houdingsfuncties die moeten worden gecodeerd Deze omvatten ode-integrators, routines voor het hanteren van modelparameters, opslaan / Het herstellen van modelstatus, visualiserende simulatieresultaten, enz. CESE biedt u de implementatie voor deze routines, vandaar dat u zich kunt concentreren op het schrijven van de code voor beton ionische stroom (en), en CESE zal de rest.Cees niet proberen om gecompliceerd te maken Programmeerkaders op zijn eigen Eerlijk gebruikt het Core Java API's. Modellen zijn bijvoorbeeld Java-componenten die voldoen aan de specificatie van Javabeans. We gebruiken XML om het klemopdrachten en de Serialisatie van Java te specificeren en Modelparameters op te slaan / herstellen. Wat is er nieuw in deze release: · Deze release voegt een GUI toe voor het wijzigen van plottypen, verbetert de prestaties en bevat verschillende belangrijke bugfixes.

Cel-elektrofysiologische simulatieomgeving Gerelateerde software