Codonw CODONW is een programma dat is ontworpen om de multivariate analyse (correspondentieanalyse) van codon- en aminozuurgebruik te vereenvoudigen.
Download nu

Codonw Rangschikking & Samenvatting

Codonw Tags

zuur codon multivariate analyse Correspondentie-analyse zuurgebruik amino

Codonw Beschrijving

CODONW is een programma dat is ontworpen om de multivariate analyse (correspondentieanalyse) van codon- en aminozuurgebruik te vereenvoudigen. CODONW is een programma dat is ontworpen om de multivariate analyse (correspondentieanalyse) van codon- en aminozuurgebruik te vereenvoudigen. Het berekent ook standaardindices van Codon-gebruik. Het heeft zowel menu- als opdrachtregelinterfaces. Het Codonw-project is geschreven door John Pedden in het lab van Paul Sharp, dept of Genetics, University of Nottingham. John werkt in menselijke genetica en is momenteel werkzaam als Procardis-databasebeheerder bij de WTCHG in Oxford University.Here zijn enkele belangrijke functies van "Codonw": · Geschreven in ANSI Compliant C · Menu aangedreven · Uitgebreid aantal opdrachtregelopties · Genetische code Onafhankelijk · Geen limieten op 1. Aantal sequenties 2. Sequentielengte · Berekent de Codon-gebruiksindices1. CAI: Codon Adaptation Index2. FOP: frequentie van optimale codons3. NC: effectief aantal codons4. CBI: CODON BIAS-index · Berekent aminozuurindexen1. Jus score2. Aromaticiteit · Berekent correspondentieanalyse van 1. Codon Usage2. RSCU (relatief synoniem codon gebruik) 3. Aminozuurgebruik · Correspondentie-analyse 1. Kan codons / aminozuren2 omvatten / uitsluiten. kan gedetailleerde rapporten van Trends3 genereren. Pogingen om optimale codons automatisch te identificeren4. Kan toestaan dat aanvullende gegevensets moeten worden toegevoegd. 5. RECords een aantal trends · Bereken Gene Parameters1. Genlengte2. GC, GC3S en Codon Positie Specifieke G + C 3. Dinucleotidesamenstelling (in alle drie Codon-frames) 4. Aminozuur gebruik 5. Relatief aminozuurgebruik6. CODON USAGE7. Relatief Synonymous Codon-gebruik · Kan Conceptueel requenties naar eiwit vertalen · Reformats-sequentiegegevens · Human of machine leesbare uitgang · CONCATENATE GENEN (tijdens het behoud van het leesframe) om te berekenen1. Algehele codon gebruik2. GC Content3. Dinucleotidesamenstelling · Genereert tabellen van codon, aminozuur of RSCU-gebruik · Kan u zelfs helpen bij het leren van de genetische code. · En meer

Codonw Gerelateerde software