Macs2 MODEL GEBASEERDE ANALYSE VOOR CHIP-SEQ-gegevens
Download nu

Macs2 Rangschikking & Samenvatting

Macs2 Tags

gegevens model- Data Analyzer

Macs2 Beschrijving

MACS2 is een op model gebaseerde analyse-tool voor Chip-SEQ-gegevens. Met de verbetering van sequencing-technieken wordt chromatine-immunoprecipitatie gevolgd door hoge doorvoersequencing (chip-seq) populair om genoom-brede eiwit-DNA-interacties te bestuderen. Om het gebrek aan krachtige Chip-SEQ-analysemethode aan te pakken, presenteren we een nieuw algoritme, met de naam Model-gebaseerde analyse van Chip-SEQ (Macs), voor het identificeren van transcriptiefactor-bindende sites. Macs legt de invloed van genoomcomplexiteit vast om de betekenis van verrijkte chipregio's te evalueren en Macs verbetert de ruimtelijke resolutie van bindingsplaatsen door de informatie te combineren van zowel de sequentielaagpositie en de oriëntatie. Macs kunnen eenvoudig worden gebruikt voor alleen chip-seq-gegevens, of met besturingsmonster met de toename van de homepage van de specificiteit.Product

Macs2 Gerelateerde software