Mauve Constructen Global Multiple Alignments Of RangedRanged Genome Sequenties
Download nu

Mauve Rangschikking & Samenvatting

Mauve Tags

Mauve uitlijning genoomuitlijning het construeren van genoomuitlijning herschikte genoomsequenties genoom

Mauve Beschrijving

Constructeert wereldwijde meerdere uitlijningen van rearranged genoomsequenties MAUVE-project is een systeem voor het efficiënt bouwen van meerdere genoomuitlijningen in de aanwezigheid van grootschalige evolutionaire evenementen zoals herschikking en inversie.MUTIPLE-genoomuitlijning biedt een basis voor onderzoek naar vergelijkende genomica en de studie van evolutionaire dynamiek op een nieuwe schaal. Het uitlijnen van hele genomes is een fundamenteel ander probleem dan het uitlijnen van korte sequenties.mauve is ontwikkeld met het idee dat een aligner met meerdere genoom alleen maar bescheiden computationele bronnen moet vereisen. Het maakt gebruik van algoritmische technieken die goed in de hoeveelheid sequentie worden uitgelijnd. Voorbeeld kunnen een paar Y.-Pestis-genomen worden uitgelijnd binnen een minuut, terwijl een groep van 9 uiteenlopende enterobacteriële genomen in een paar uur kan worden uitgelijnd.

Mauve Gerelateerde software