Neuronvisio Een gebruikersinterface voor de omgeving van Neuron Simulator
Download nu

Neuronvisio Rangschikking & Samenvatting

Neuronvisio Tags

visualisatie voorkant 3D-visualisatie Neuron gui simulator milieu NEURON

Neuronvisio Beschrijving

Een gebruikersinterface voor de omgeving van Neuron Simulator Neuronvisio verbindt met Neuron met behulp van de nieuwe Python Neuron-interface.Installatie: om Neuronvisio te installeren, moet u voldoen aan de volgende afhankelijkheden * Pygtk * Visual * Matplotlibeasy Installeer de gemakkelijkste manier om Neuronvisio te krijgen is als u Setuptools hebt geïnstalleerd: Easy_Install Neuronvisiowithout Setuptools, het is nog steeds vrij eenvoudig . Download het neuronvisio.tgz-bestand van de CHEASESHOP-pagina van Neuronvisio, UNTARD IT en RUN: Python Setup.py InstallDocumentation De documentatie is beschikbaar in de DOC-map of online.QuickStartDeS-code is gewoon om een idee te geven van het gebruik van NRNVISIO-module: 1. Vuur een IPYTHON-console op met PYLAB-schakelaar.: IPYTHON -PYLAB # Als u de schakelaar niet gebruikt, ziet u geen grafiek.2. Importeer de module: van Neuronvisio.Controls Import Controls-besturingselementen = bedieningselementen () Wanneer NRNVISIO wordt gestart, wordt de draad gelanceerd. In deze thread zal al het proces van NRNVISIO gebeuren zonder de console te blokkeren. Als een snelvoorbeeld de volgende code: 1. Maakt een enkele sectie genaamd Soma 2. Plaats een Hodgkey-Huxley-kanaal en een passieve geleiding 3. Plaats een alphasynaps Een stimules.A Snel voorbeeld kan de volgende zijn :: van nrnvisio.Controls Import ControlScontrols = bedieningselementen () # Starten van de Guifrom Neuron import H # Krijg de hocinterpretersoma = H.Section () # Een sectiesa maken. # Een HH kanelsoma invoegen.inert ('PAS') # Invoegen van een passieve geleidesyn = H.Alpasynapse (0.5, sec = soma) # synaptisch ingangssyn.onset = 0.5 # Wanneer naar Firesyn.gmax = 0,05 # De geleiding van de synapsesyn. E = 0 # Het Reversal PotentialMore-voorbeeld in de voorbeeldmap laat zien hoe u Neuronvisio gebruikt met een meer complex model. Hier zijn enkele belangrijke kenmerken van "Neuronvisio": · 3D-visualisatie van het model met de mogelijkheid om het runtime te wijzigen · Creëren van vectoren om elke aanwezige variabelen in de sectie op te nemen · Pylab-integratie om direct het resultaat van de simulatie te plotten · Verkenning van het tijdstip van elke variabele in de tijd met behulp van een kleurcode · De GUI loopt in zijn eigen draad, dus het is mogelijk om de console te gebruiken (sterk voorgesteld IPYTHON) Vereisten: · Python

Neuronvisio Gerelateerde software